More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2460 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  72.68 
 
 
209 aa  310  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  69.08 
 
 
209 aa  296  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  69.08 
 
 
209 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  65.05 
 
 
212 aa  287  7e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  64.9 
 
 
213 aa  281  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 
210 aa  281  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  65.38 
 
 
210 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  65.22 
 
 
209 aa  277  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  62.02 
 
 
211 aa  269  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 
209 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  60.29 
 
 
209 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  62.69 
 
 
213 aa  261  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  61.84 
 
 
211 aa  258  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  58.1 
 
 
211 aa  256  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  60.49 
 
 
211 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  58.29 
 
 
212 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  60.39 
 
 
210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  59.13 
 
 
210 aa  251  7e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 
210 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  60 
 
 
212 aa  249  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  59.9 
 
 
210 aa  249  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
210 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 
210 aa  234  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  55.56 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  55.77 
 
 
222 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  56.65 
 
 
211 aa  231  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  57 
 
 
208 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 
210 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  55.5 
 
 
216 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  54.13 
 
 
220 aa  229  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  56.46 
 
 
208 aa  229  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  55.98 
 
 
218 aa  228  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  53.66 
 
 
215 aa  228  7e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  53.11 
 
 
211 aa  227  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
211 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 
210 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  53.21 
 
 
220 aa  225  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  56.41 
 
 
211 aa  225  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  51.01 
 
 
217 aa  225  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  53.62 
 
 
205 aa  223  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  55.5 
 
 
216 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  55.98 
 
 
213 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 
212 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  54.41 
 
 
212 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  54.59 
 
 
227 aa  222  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 
218 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 
207 aa  222  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  56.37 
 
 
207 aa  222  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  54.9 
 
 
212 aa  221  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  51.96 
 
 
218 aa  221  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  52.29 
 
 
220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
218 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  53.69 
 
 
213 aa  221  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 
212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  52.66 
 
 
209 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 
221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  52.45 
 
 
206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  54.46 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  53.11 
 
 
215 aa  218  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 
207 aa  218  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  53.55 
 
 
207 aa  217  8.999999999999998e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  53.59 
 
 
217 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 
228 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 
219 aa  215  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000163613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  52.86 
 
 
210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  52.02 
 
 
209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
219 aa  215  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  53.59 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
211 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  54.41 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1955  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  52.4 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  52.8 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  52.43 
 
 
226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  51.47 
 
 
208 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 
223 aa  210  1e-53  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 
217 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 
217 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  51.64 
 
 
217 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 
219 aa  209  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 
223 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  50.49 
 
 
219 aa  209  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  51.2 
 
 
212 aa  207  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  48.54 
 
 
210 aa  207  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  48.53 
 
 
206 aa  207  9e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  49.02 
 
 
219 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>