More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2193 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.71 
 
 
687 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.55 
 
 
686 aa  641    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.28 
 
 
676 aa  707    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  49 
 
 
893 aa  688    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.85 
 
 
677 aa  738    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.79 
 
 
674 aa  711    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.64 
 
 
674 aa  713    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.71 
 
 
676 aa  702    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.15 
 
 
688 aa  655    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  46.27 
 
 
695 aa  639    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.21 
 
 
674 aa  707    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.5 
 
 
674 aa  709    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  44.96 
 
 
713 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  100 
 
 
745 aa  1543    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  50.14 
 
 
899 aa  676    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.21 
 
 
893 aa  729    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.01 
 
 
688 aa  661    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  48.24 
 
 
687 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.99 
 
 
723 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.44 
 
 
917 aa  689    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.51 
 
 
901 aa  667    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.37 
 
 
900 aa  662    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.66 
 
 
879 aa  659    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.75 
 
 
900 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.52 
 
 
893 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.39 
 
 
688 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.71 
 
 
676 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  47 
 
 
920 aa  637    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  48.31 
 
 
689 aa  660    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.44 
 
 
904 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.61 
 
 
716 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.54 
 
 
688 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.29 
 
 
716 aa  631  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.05 
 
 
911 aa  625  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
716 aa  626  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.13 
 
 
715 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.14 
 
 
906 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.75 
 
 
716 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.88 
 
 
886 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  45.13 
 
 
715 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  45.13 
 
 
715 aa  624  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.73 
 
 
898 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  44.63 
 
 
716 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.01 
 
 
689 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.86 
 
 
1440 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.65 
 
 
686 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.19 
 
 
718 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.68 
 
 
1428 aa  594  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.37 
 
 
685 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.85 
 
 
715 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.85 
 
 
715 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.85 
 
 
715 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  43.71 
 
 
715 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.71 
 
 
715 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  43.71 
 
 
715 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.43 
 
 
903 aa  589  1e-167  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.99 
 
 
905 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.96 
 
 
1421 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.18 
 
 
1410 aa  588  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.56 
 
 
1440 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.08 
 
 
1425 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.03 
 
 
1406 aa  581  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.79 
 
 
668 aa  581  1e-164  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  44.98 
 
 
1387 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.44 
 
 
1425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.38 
 
 
1432 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.46 
 
 
685 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.24 
 
 
1432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.46 
 
 
1110 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.1 
 
 
1425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.96 
 
 
1424 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.1 
 
 
1432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.13 
 
 
1111 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  44.35 
 
 
1385 aa  572  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.68 
 
 
925 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.76 
 
 
724 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0200  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  49.3 
 
 
590 aa  559  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 
687 aa  558  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.16 
 
 
808 aa  561  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  43.99 
 
 
1412 aa  562  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.42 
 
 
1426 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 
945 aa  554  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 
1130 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.23 
 
 
937 aa  552  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  40.59 
 
 
737 aa  549  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  49.12 
 
 
581 aa  548  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 
963 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 
933 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 
949 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 
957 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  50.27 
 
 
527 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.12 
 
 
541 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.6 
 
 
988 aa  532  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 
953 aa  535  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.2 
 
 
754 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  48.85 
 
 
536 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 
988 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  47.83 
 
 
527 aa  532  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.92 
 
 
924 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
662 aa  529  1e-149  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>