More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2172 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  60.8 
 
 
251 aa  331  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  61.54 
 
 
260 aa  329  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  56.81 
 
 
254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  49.63 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  45.02 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  44.18 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
240 aa  211  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  44.22 
 
 
249 aa  207  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.08 
 
 
253 aa  206  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.37 
 
 
237 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.55 
 
 
265 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.4 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  40.71 
 
 
246 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  40.71 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  38.15 
 
 
236 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.96 
 
 
237 aa  189  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.68 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  40.94 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
250 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  39.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  40.55 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  39.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  39.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  39.92 
 
 
246 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  39.92 
 
 
246 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  40.16 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.65 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  37.65 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  39.53 
 
 
246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  37.65 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  37.25 
 
 
243 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  37.25 
 
 
243 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  37.25 
 
 
243 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.29 
 
 
249 aa  178  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.5 
 
 
261 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  38.65 
 
 
246 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  38.65 
 
 
246 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.08 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  33.73 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  33.73 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  36.78 
 
 
268 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.41 
 
 
245 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  33.73 
 
 
245 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  35.11 
 
 
262 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  36.26 
 
 
257 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.68 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.85 
 
 
244 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
265 aa  161  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  36.3 
 
 
268 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.08 
 
 
266 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  33.6 
 
 
244 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  34.23 
 
 
265 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  34.43 
 
 
247 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.31 
 
 
260 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  34.8 
 
 
244 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.95 
 
 
257 aa  155  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  38 
 
 
239 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
247 aa  154  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  38 
 
 
239 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.6 
 
 
239 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  37.2 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.44 
 
 
239 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  35.25 
 
 
268 aa  152  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  36.84 
 
 
249 aa  152  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.38 
 
 
257 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  37.6 
 
 
250 aa  152  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.46 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  36.9 
 
 
243 aa  152  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  34.32 
 
 
276 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  38.58 
 
 
261 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  35.31 
 
 
280 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.46 
 
 
244 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.5 
 
 
237 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  34.93 
 
 
272 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.4 
 
 
241 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.07 
 
 
285 aa  149  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.57 
 
 
242 aa  148  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  34.73 
 
 
239 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  35.41 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>