112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2111 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_2111  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like  100 
 
 
339 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1138  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  33.24 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2801  hypothetical protein  31.11 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1110  hypothetical protein  28.73 
 
 
338 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2640  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  25.14 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.86 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2957  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.35 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2886  uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  27.2 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4610  hypothetical protein  25.3 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.130113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2125  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  27.7 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1934  uroporphyrinogen decarboxylase  32.22 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4642  Uroporphyrinogen-III decarboxylase-like protein  26.21 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2932  hypothetical protein  28.37 
 
 
397 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  24.81 
 
 
556 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.39 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.83 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  32.3 
 
 
351 aa  60.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  24.78 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  30.49 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  28.48 
 
 
386 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.53 
 
 
367 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  25.38 
 
 
351 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  30.06 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  30.06 
 
 
361 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  31.06 
 
 
351 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1897  hypothetical protein  23.77 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.73 
 
 
341 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  27.56 
 
 
351 aa  55.8  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1317  hypothetical protein  23.17 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  27.86 
 
 
364 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  24.77 
 
 
335 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  30.82 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  29.3 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  31.67 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1828  hypothetical protein  22.51 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  31.67 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  29.15 
 
 
343 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  30.38 
 
 
356 aa  53.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  31.68 
 
 
351 aa  52.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  26.98 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0386  hypothetical protein  22.95 
 
 
389 aa  52  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.33173  normal  0.334793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1314  hypothetical protein  23.47 
 
 
438 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.42967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  34.86 
 
 
365 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  26.51 
 
 
355 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.37 
 
 
349 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  31.68 
 
 
355 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  27.86 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  29.29 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0025  uroporphyrinogen decarboxylase  30.82 
 
 
356 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  23.11 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.34 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2779  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  31.01 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.313146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  30.38 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  26.51 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  23.11 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2963  hypothetical protein  30.65 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0734649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  23.11 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0721  hypothetical protein  25.67 
 
 
391 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.08 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  31.45 
 
 
354 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  29.68 
 
 
351 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0414  uroporphyrinogen decarboxylase  31.45 
 
 
354 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  26.52 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  24.49 
 
 
380 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3303  uroporphyrinogen decarboxylase  28.43 
 
 
364 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0163615  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  27.63 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  27.37 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  27.81 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  27.02 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  24.27 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  27.27 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.64 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  22.86 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2369  hypothetical protein  23.89 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  30.63 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  28.75 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  28.48 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  26.09 
 
 
339 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  28.48 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  26.71 
 
 
355 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  26.18 
 
 
356 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  27.07 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3524  uroporphyrinogen decarboxylase  30.38 
 
 
356 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  33.08 
 
 
350 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1830  uroporphyrinogen decarboxylase  30.59 
 
 
356 aa  46.6  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  26.52 
 
 
354 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3174  uroporphyrinogen decarboxylase  28.43 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.336159  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.29 
 
 
344 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1836  hypothetical protein  23.48 
 
 
388 aa  46.2  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  27.85 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  27.81 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  30 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  30 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3498  uroporphyrinogen decarboxylase  28.43 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  24.36 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  27.62 
 
 
354 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  25.64 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  25.82 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  22.66 
 
 
617 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>