More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1825 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
299 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  44.24 
 
 
297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  44.26 
 
 
295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
295 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
308 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
298 aa  209  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
302 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 
307 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
318 aa  191  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 
304 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 
304 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 
314 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 
293 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
298 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
300 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  37.63 
 
 
314 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 
305 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 
305 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 
310 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 
298 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
319 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 
312 aa  176  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
294 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
303 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 
298 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2226  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
298 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
309 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  37.63 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
290 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1737  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
308 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379475  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 
322 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 
297 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
297 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
299 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 
297 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 
297 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 
305 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
313 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  34.13 
 
 
316 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  32.18 
 
 
298 aa  166  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  34.09 
 
 
301 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
313 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0108  transcriptional regulator, LysR family  38.27 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.375048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
318 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 
296 aa  162  7e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
294 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
326 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.81 
 
 
300 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 
297 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 
299 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
296 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
296 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 
327 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
337 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 
303 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  35.82 
 
 
327 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
295 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
302 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 
300 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
337 aa  158  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
297 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2243  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
302 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
298 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
289 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
298 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
297 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 
334 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  37.83 
 
 
302 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 
309 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 
309 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
295 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 
305 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
298 aa  155  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  35.02 
 
 
331 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  33.78 
 
 
329 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
297 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0426  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
308 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
307 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 
316 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3123  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 
293 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  35.03 
 
 
307 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 
322 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>