More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1501 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  59.8 
 
 
296 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  59.12 
 
 
296 aa  362  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  55.93 
 
 
295 aa  361  8e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  56.9 
 
 
299 aa  352  6e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  350  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  349  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  53.72 
 
 
296 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  349  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  349  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.39 
 
 
296 aa  349  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.05 
 
 
296 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  54.05 
 
 
296 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  53.22 
 
 
296 aa  339  3e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  50.51 
 
 
294 aa  330  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  55.03 
 
 
298 aa  328  8e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  53.9 
 
 
295 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  49.32 
 
 
296 aa  312  5e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  47.8 
 
 
295 aa  302  5e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  51.35 
 
 
302 aa  299  4e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  46.92 
 
 
297 aa  295  5e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  47.18 
 
 
302 aa  294  9e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  46.84 
 
 
302 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  47.12 
 
 
295 aa  292  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  47.12 
 
 
295 aa  292  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  46.84 
 
 
302 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  49.48 
 
 
294 aa  289  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  48.45 
 
 
297 aa  285  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  48.99 
 
 
292 aa  284  1e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  48.66 
 
 
292 aa  283  2e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  44.78 
 
 
302 aa  284  2e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  8.94527e-13 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  47.46 
 
 
295 aa  283  3e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  49.66 
 
 
295 aa  282  4e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  48.66 
 
 
320 aa  282  5e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  48.14 
 
 
295 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  47.12 
 
 
295 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  47.75 
 
 
302 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  45.55 
 
 
291 aa  272  4e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  48.14 
 
 
306 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 
295 aa  270  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  47.8 
 
 
294 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  48.11 
 
 
298 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  45.42 
 
 
295 aa  268  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.92 
 
 
298 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.26 
 
 
298 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.92 
 
 
298 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  47.77 
 
 
314 aa  266  3e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  46.31 
 
 
303 aa  265  8e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  46.64 
 
 
314 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  46.44 
 
 
307 aa  264  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.24 
 
 
298 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  46.44 
 
 
307 aa  263  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  45.7 
 
 
296 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  44.92 
 
 
362 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.83292e-06 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  45.64 
 
 
299 aa  262  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  44.56 
 
 
302 aa  263  4e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  43.85 
 
 
308 aa  262  5e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  46.05 
 
 
321 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  44.88 
 
 
346 aa  261  7e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  46.34 
 
 
290 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  47.26 
 
 
308 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  47.08 
 
 
298 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 
298 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.88 
 
 
298 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  44.56 
 
 
301 aa  259  5e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 
298 aa  259  5e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  46.1 
 
 
307 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  43.67 
 
 
298 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.12 
 
 
299 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.12 
 
 
299 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  46.64 
 
 
313 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  6.34873e-09 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.12 
 
 
299 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  45.17 
 
 
317 aa  256  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  44.22 
 
 
298 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  47.95 
 
 
309 aa  256  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  1.28305e-09 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  47.35 
 
 
321 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.88 
 
 
298 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 
306 aa  255  6e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  43.84 
 
 
300 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  44.22 
 
 
297 aa  254  8e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  43.73 
 
 
301 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  43.54 
 
 
304 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  44.67 
 
 
303 aa  254  1e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  6.35712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  45.58 
 
 
313 aa  251  7e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.75 
 
 
300 aa  251  7e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  42.52 
 
 
301 aa  251  8e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  41.41 
 
 
296 aa  251  8e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  45.02 
 
 
299 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  43.05 
 
 
305 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2258  tyrosine recombinase XerD  48.11 
 
 
298 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  41.69 
 
 
304 aa  249  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  44.75 
 
 
292 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.2 
 
 
298 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.59 
 
 
299 aa  249  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1659  tyrosine recombinase XerD subunit  42.18 
 
 
296 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 
311 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  47.5 
 
 
310 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>