253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1116 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1116  RNA-binding protein Hfq  100 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000543156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2729  RNA chaperone Hfq  68.67 
 
 		 83 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.943710000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0557  RNA chaperone Hfq  74.32 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1881  RNA chaperone Hfq  71.83 
 
 		 80 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.318606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2131  RNA chaperone Hfq  69.01 
 
 		 80 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.187321  normal  0.0262415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1921  RNA chaperone Hfq  59.26 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0980  hypothetical protein  63.01 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1490  RNA chaperone Hfq  58.33 
 
 		 86 aa  110  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0924374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1694  RNA chaperone Hfq  63.29 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0182098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1361  RNA chaperone Hfq  67.14 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000362594  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1174  RNA chaperone Hfq  67.14 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0774  RNA chaperone Hfq  59.26 
 
 		 82 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000911615  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1614  RNA chaperone Hfq  61.04 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000077462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1497  RNA chaperone Hfq  62.16 
 
 		 92 aa  99.4  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2390  RNA-binding protein Hfq  63.77 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000174663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3812  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000446161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1490  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177401  normal  0.0133073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3740  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000182671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3559  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3458  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000205772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3472  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3763  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3842  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000757377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3722  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.2599e-36 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3478  RNA-binding protein Hfq  62.32 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000029119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1684  RNA-binding protein Hfq  55 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11580  RNA chaperone Hfq  58.67 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2610  RNA-binding protein Hfq  58.67 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.279445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1762  RNA chaperone Hfq  50.62 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.683558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1613  RNA-binding protein Hfq  52.44 
 
 		 82 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1223  RNA-binding protein Hfq  60.87 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0482  RNA chaperone Hfq  55.41 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.393175  hitchhiker  0.000910775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5942  RNA chaperone Hfq  57.33 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6544  RNA chaperone Hfq  57.33 
 
 		 84 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3124  RNA chaperone Hfq  56.79 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4393  RNA chaperone Hfq  63.64 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2103  RNA-binding protein Hfq  57.97 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1448  RNA-binding protein Hfq  63.64 
 
 		 90 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.581854  hitchhiker  0.000378907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1760  RNA chaperone Hfq  57.14 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000103863  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0121  RNA chaperone Hfq  57.53 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0251  RNA-binding protein Hfq  53.85 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.222579  normal  0.069598 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1493  RNA-binding protein Hfq  56.94 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.964703  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2843  RNA-binding protein Hfq  56.94 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.736896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2244  RNA-binding protein Hfq  54.17 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0488883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1451  RNA-binding protein Hfq  56.94 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0535  RNA chaperone Hfq  57.14 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2824  RNA chaperone Hfq  56 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.171774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3051  RNA chaperone Hfq  56 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1356  RNA-binding protein Hfq  55.56 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.950341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2942  RNA chaperone Hfq  56 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.621816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1493  RNA chaperone Hfq  55.26 
 
 		 83 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.579375  normal  0.208589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1499  RNA-binding protein Hfq  45.24 
 
 		 84 aa  90.1  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1632  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614603  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_004310  BR1111  RNA-binding protein Hfq  51.28 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1567  RNA-binding protein Hfq  56.06 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.104021  normal  0.0520931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1095  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1070  RNA-binding protein Hfq  51.28 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2139  RNA chaperone Hfq  50 
 
 		 109 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2208  RNA-binding protein Hfq  51.28 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1819  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798062  normal  0.0504163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4124  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304133  normal  0.524604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4073  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2867  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.648341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1525  RNA chaperone Hfq  52.63 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396727  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2878  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2582  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233324  normal  0.226636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2594  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  0.0249757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1449  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.083877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1841  RNA-binding protein Hfq  59.09 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2980  RNA-binding protein Hfq  56.94 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1931  RNA-binding protein Hfq  61.67 
 
 		 193 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1272  RNA-binding protein Hfq  54.55 
 
 		 196 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0395  RNA chaperone Hfq  51.28 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000648221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002259  RNA-binding protein Hfq  51.19 
 
 		 87 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.912109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0603  host factor-I protein  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0558  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00283933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3767  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00011566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3893  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0570071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3710  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.42469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00094  RNA-binding protein Hfq  50 
 
 		 87 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0598  RNA-binding protein Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00147514  hitchhiker  0.00000962833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3432  RNA-binding protein Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.528645  normal  0.0945438 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0411  RNA chaperone Hfq  53.85 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.879276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4170  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0476291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0597  RNA-binding protein Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.448781  hitchhiker  0.00000118044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3280  RNA chaperone Hfq  52.5 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0797  RNA chaperone Hfq  51.32 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.733569  hitchhiker  0.00597566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3311  RNA chaperone Hfq  54.67 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4685  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0624  RNA-binding protein Hfq  51.52 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00135703  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1468  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.859104  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5108  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.203051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3540  RNA chaperone Hfq  51.32 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.132549  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6272  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298535  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1807  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1429  RNA chaperone Hfq  53.33 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.180806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1831  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.781797  normal  0.415294 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3821  RNA chaperone Hfq  55.38 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000750776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1415  RNA-binding protein Hfq  52.11 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152957 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1829  RNA-binding protein Hfq  50.68 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>