More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1028 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  50 
 
 
317 aa  276  5e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  52.17 
 
 
293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  49.33 
 
 
294 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  43.29 
 
 
298 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  51.52 
 
 
293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  47.02 
 
 
307 aa  268  8e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  47.1 
 
 
299 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  46.91 
 
 
307 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  46.92 
 
 
290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  46.69 
 
 
307 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  47.28 
 
 
302 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  47.67 
 
 
294 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  51.19 
 
 
294 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  49.83 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  49 
 
 
302 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  46.64 
 
 
295 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  43.67 
 
 
301 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  42.14 
 
 
295 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  46.67 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.91 
 
 
299 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  41.41 
 
 
296 aa  249  6e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  47 
 
 
300 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  248  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.63 
 
 
299 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
296 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
296 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.96 
 
 
299 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 
296 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
296 aa  245  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
296 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.62 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  43.71 
 
 
296 aa  245  8e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.09 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  43.58 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.96 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 
296 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  41.64 
 
 
296 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  41.53 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 
295 aa  242  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  45.36 
 
 
298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  42.9 
 
 
332 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  47.71 
 
 
311 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  48.03 
 
 
342 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  43.1 
 
 
300 aa  235  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  44.97 
 
 
295 aa  235  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  40.33 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  45.42 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  41.89 
 
 
296 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  47.84 
 
 
343 aa  231  9e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.18 
 
 
295 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.18 
 
 
295 aa  230  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  43.91 
 
 
320 aa  230  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  47.51 
 
 
343 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  41 
 
 
306 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  44 
 
 
295 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.92 
 
 
297 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  42.47 
 
 
298 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  38.18 
 
 
294 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  42.47 
 
 
298 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  41.97 
 
 
308 aa  226  3e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  44.52 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  37 
 
 
302 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  42.07 
 
 
300 aa  224  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  43.79 
 
 
310 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  39.4 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  41.06 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  38.13 
 
 
299 aa  222  6e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  39.19 
 
 
298 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  41.81 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  43.55 
 
 
313 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  41.75 
 
 
309 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  44.3 
 
 
298 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  40.8 
 
 
295 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  40.34 
 
 
308 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.74 
 
 
302 aa  218  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  39.14 
 
 
297 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  40.58 
 
 
303 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  39.07 
 
 
302 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  42.28 
 
 
292 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  41.78 
 
 
308 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  40 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  44.59 
 
 
292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  41.36 
 
 
321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 
303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 
298 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>