More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0888 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  64.39 
 
 		 277 aa  374  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  59.93 
 
 		 283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  56.99 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  54.26 
 
 		 278 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  57.97 
 
 		 278 aa  312  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  51.61 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  54.8 
 
 		 282 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  53.55 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 277 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  53.57 
 
 		 278 aa  308  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  54.61 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 277 aa  304  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  53.38 
 
 		 282 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  54.15 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 		 279 aa  298  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 281 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  52.3 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 278 aa  297  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  52.86 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  53 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 287 aa  295  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  52.5 
 
 		 278 aa  295  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  51.6 
 
 		 279 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  53.09 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  52.33 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  56.32 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 280 aa  285  5e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  285  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 		 288 aa  278  7e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 279 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  47.62 
 
 		 269 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  51.43 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  45.36 
 
 		 407 aa  248  8e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  48.4 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  45.86 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 368 aa  245  6e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  49.12 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 277 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  48.41 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 292 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 355 aa  232  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  46.64 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  45.99 
 
 		 288 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  44.95 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  44.96 
 
 		 281 aa  228  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  40.96 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  44.1 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  44.93 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  44.52 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  45.67 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  43.94 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  44.93 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  44.93 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 299 aa  217  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  44.93 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>