12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0680 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0680    100 
 
 
409 bp  811    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000136443  unclonable  0.00000000949749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0677    89.94 
 
 
536 bp  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0718829  unclonable  0.00000000902023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0683    89.33 
 
 
339 bp  359  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436933  unclonable  0.00000000883474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  92 
 
 
1014 bp  67.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1537  UDP-glucose 4-epimerase  96.77 
 
 
1020 bp  54  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  96.67 
 
 
981 bp  52  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  93.75 
 
 
996 bp  48.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  90 
 
 
975 bp  48.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  88.37 
 
 
996 bp  46.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  91.43 
 
 
990 bp  46.1  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
951 bp  46.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  91.43 
 
 
960 bp  46.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>