More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0275 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  100 
 
 
155 aa  311  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  74 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  73.1 
 
 
153 aa  224  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  66.67 
 
 
152 aa  213  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  68.24 
 
 
150 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  64.67 
 
 
155 aa  208  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  64 
 
 
156 aa  207  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  60.67 
 
 
157 aa  200  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  62.67 
 
 
155 aa  199  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  60.4 
 
 
172 aa  198  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  59.33 
 
 
155 aa  198  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  58.71 
 
 
155 aa  197  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  59.06 
 
 
153 aa  196  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  60.39 
 
 
157 aa  196  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  61.33 
 
 
156 aa  196  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  59.33 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  66.42 
 
 
153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  59.33 
 
 
155 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  63.01 
 
 
154 aa  194  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  64.43 
 
 
159 aa  193  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  64.43 
 
 
159 aa  192  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  59.46 
 
 
154 aa  191  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  58 
 
 
155 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  63.95 
 
 
158 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  56.67 
 
 
155 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  57.79 
 
 
159 aa  188  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  60.4 
 
 
158 aa  187  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  60.67 
 
 
158 aa  187  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  60.4 
 
 
159 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  55.33 
 
 
155 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  61.74 
 
 
159 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  60.93 
 
 
158 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  56.38 
 
 
151 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  60.28 
 
 
150 aa  184  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  60.28 
 
 
150 aa  184  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  55.7 
 
 
152 aa  184  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  59.03 
 
 
162 aa  183  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  59.87 
 
 
160 aa  183  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  60.67 
 
 
158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  57.05 
 
 
157 aa  181  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  60 
 
 
157 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  60 
 
 
157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  60.42 
 
 
160 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  58.78 
 
 
161 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  59.59 
 
 
161 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  56.67 
 
 
157 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  58.78 
 
 
154 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  58 
 
 
157 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  58 
 
 
157 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
160 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  60.96 
 
 
152 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
157 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  57.33 
 
 
157 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  55.63 
 
 
156 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  54.36 
 
 
156 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  54.36 
 
 
156 aa  174  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  56.85 
 
 
147 aa  173  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  57.05 
 
 
157 aa  173  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  57.82 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  57.43 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  53.02 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  55.92 
 
 
168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  55.1 
 
 
151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  57.05 
 
 
165 aa  171  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
155 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  56.95 
 
 
161 aa  170  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  58.22 
 
 
155 aa  170  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  53.25 
 
 
155 aa  170  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  55.78 
 
 
158 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  55.56 
 
 
160 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  52.6 
 
 
154 aa  168  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  56.3 
 
 
150 aa  167  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
149 aa  168  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  57.14 
 
 
155 aa  168  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
155 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  53.02 
 
 
159 aa  167  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  56.25 
 
 
158 aa  167  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
157 aa  167  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  56.08 
 
 
158 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  52.67 
 
 
152 aa  167  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  55.78 
 
 
158 aa  166  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
162 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  53.74 
 
 
158 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  57.24 
 
 
158 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  54.9 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  54 
 
 
155 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  57.53 
 
 
159 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  54 
 
 
155 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  54.42 
 
 
158 aa  164  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  55.41 
 
 
159 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>