More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8811 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8811  Resolvase domain protein  100 
 
 		 227 aa  441  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6912  resolvase domain-containing protein  83.22 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4956  resolvase domain-containing protein  58.52 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2725  Resolvase domain protein  55.26 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0893  Resolvase domain protein  54.46 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1223  resolvase domain-containing protein  62.67 
 
 		 225 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2996  Resolvase domain  54.26 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7497  Resolvase domain protein  52.86 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1741  Resolvase domain  49.78 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2389  Resolvase domain  59.11 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1482  resolvase domain-containing protein  52.42 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2281  resolvase-like protein  51.15 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00855121  normal  0.056664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2499  resolvase, N-terminal  49.78 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.994531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0275  resolvase domain-containing protein  44.54 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0802  resolvase, N-terminal  48.91 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000162467  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3656  resolvase-like protein  48.88 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2472  resolvase domain-containing protein  48.48 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3483  Resolvase domain  46.02 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7746  Resolvase domain protein  46.82 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3788  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0923  resolvase-like protein  47.86 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8420  Resolvase domain protein  58.64 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875604  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7010  Resolvase domain protein  46.76 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2451  resolvase domain-containing protein  46.4 
 
 		 268 aa  147  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4942  putative DNA-invertase (site-specific recombinase)  42.34 
 
 		 214 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.406148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4233  Resolvase domain  44.14 
 
 		 216 aa  138  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4298  hypothetical protein  48.64 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6747  putative resolvase (site-specific recombinase)  46.26 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1116  resolvase family site-specific recombinase  38.53 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4152  resolvase domain-containing protein  46.4 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3000  Resolvase domain  37.89 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0209  Resolvase domain  36.78 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3478  resolvase domain-containing protein  34.54 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4394  resolvase domain-containing protein  40.29 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  73.75 
 
 		 315 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6343  resolvase domain protein  37.7 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3786  Resolvase domain  35.12 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.366578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3500  resolvase-like protein  34.16 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22080  resolvase  35.22 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000105368  unclonable  3.95615e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3908  resolvase domain-containing protein  38.72 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.582833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1421  Resolvase domain protein  40.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.510042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3250  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.6 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3649  resolvase domain-containing protein  35.09 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.340945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1088  resolvase domain-containing protein  32.75 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  37.32 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3595  resolvase domain-containing protein  30.43 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.03 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.03 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  40.69 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.24 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4374  Resolvase domain  41.67 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  39.31 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  37.5 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  37.5 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  37.5 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1424  Resolvase domain protein  31.72 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00141617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  29.2 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  38.61 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  37.75 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  29.46 
 
 		 665 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  38.51 
 
 		 189 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.31 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.31 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0019  Resolvase domain protein  39.22 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  44.95 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  35.43 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  40.28 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  36.49 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.22 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  37.09 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  30.92 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  35.37 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.36 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  36.54 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1983  resolvase domain-containing protein  35.98 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.528796 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.84 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  33.09 
 
 		 474 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  38.26 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  38.26 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  38.26 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.08 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.97 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  34.84 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  29.53 
 
 		 462 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  38.12 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  36.18 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  39.33 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.36 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  35.44 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  29.46 
 
 		 613 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.43 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  35.44 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  38.19 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.66 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>