194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8810 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  85.87 
 
 
596 aa  885  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
724 aa  1399  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  85.87 
 
 
599 aa  884  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  54.25 
 
 
1141 aa  401  1e-110  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  44.64 
 
 
1219 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 
1621 aa  268  3e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 
994 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
1911 aa  221  3e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  40.24 
 
 
1779 aa  218  3e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  38.8 
 
 
1448 aa  207  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 
1083 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
1711 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
1544 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  29.05 
 
 
934 aa  180  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  40.94 
 
 
560 aa  179  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  35.81 
 
 
552 aa  176  2e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
1119 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
1247 aa  164  8e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 
1321 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  36.9 
 
 
714 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.14 
 
 
992 aa  150  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  43.12 
 
 
1502 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  43.03 
 
 
1869 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  28.37 
 
 
982 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
1054 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  38.63 
 
 
393 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  39 
 
 
476 aa  137  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  29.88 
 
 
445 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  31.9 
 
 
720 aa  129  2e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.42 
 
 
632 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 
878 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.61 
 
 
644 aa  120  8e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.3 
 
 
810 aa  115  2e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.2 
 
 
1694 aa  113  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
422 aa  112  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  31.09 
 
 
737 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  30.89 
 
 
720 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26.96 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.49 
 
 
732 aa  90.9  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0048  tetratricopeptide domain-containing protein  26.08 
 
 
897 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467809 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
543 aa  87.4  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 
685 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  21.69 
 
 
962 aa  83.2  1e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  32.79 
 
 
341 aa  82.8  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.4 
 
 
1611 aa  83.2  2e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  36.84 
 
 
326 aa  82  4e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2334  copper amine oxidase domain protein  26.15 
 
 
460 aa  80.9  7e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.35 
 
 
1056 aa  80.1  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.46 
 
 
725 aa  79  3e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
1022 aa  78.2  6e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  32.98 
 
 
327 aa  77.4  9e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
909 aa  77  1e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  34.59 
 
 
322 aa  76.3  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  34.59 
 
 
322 aa  76.3  2e-12  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1253  hypothetical protein  34.43 
 
 
458 aa  76.3  2e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.238596  normal  0.0174069 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  37.01 
 
 
332 aa  75.5  3e-12  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  33.51 
 
 
325 aa  73.6  1e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.04 
 
 
988 aa  73.9  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
681 aa  73.6  1e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  36.73 
 
 
337 aa  72.4  3e-11  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  31.91 
 
 
325 aa  72.4  3e-11  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
927 aa  70.5  1e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 
730 aa  70.1  1e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.8 
 
 
1266 aa  69.7  2e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  35.68 
 
 
326 aa  69.7  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 
362 aa  69.7  2e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  35.68 
 
 
326 aa  69.7  2e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  38.04 
 
 
405 aa  69.3  2e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
784 aa  68.9  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.96 
 
 
818 aa  68.9  3e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.14 
 
 
2145 aa  68.9  3e-10  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
412 aa  67.8  7e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
615 aa  67.4  9e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 
991 aa  66.6  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.27 
 
 
623 aa  65.5  4e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  30.91 
 
 
1123 aa  65.1  5e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25.56 
 
 
799 aa  63.9  9e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  28.48 
 
 
932 aa  63.5  1e-08  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  37.96 
 
 
682 aa  63.5  1e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.93 
 
 
764 aa  63.2  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.45 
 
 
1056 aa  63.2  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  28.09 
 
 
493 aa  62.8  2e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 
1094 aa  62  4e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.93 
 
 
1238 aa  61.6  5e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.57 
 
 
816 aa  61.2  7e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
824 aa  61.2  7e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 
1082 aa  60.8  9e-08  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  25 
 
 
587 aa  60.8  9e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
1288 aa  60.5  1e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
817 aa  60.1  1e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.7 
 
 
626 aa  60.5  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
1486 aa  60.5  1e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.52 
 
 
733 aa  58.9  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
702 aa  59.3  3e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  30.89 
 
 
830 aa  58.5  4e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 
523 aa  58.2  5e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
1737 aa  58.2  6e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
955 aa  57.4  9e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
578 aa  57  1e-06  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 
620 aa  57  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>