More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8808 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  97.94 
 
 		 243 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  64.2 
 
 		 243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  63.79 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  63.16 
 
 		 247 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0789  beta-lactamase-like  53.28 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.514573 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  50.61 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4621  Beta-lactamase-like  50.2 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0866  beta-lactamase domain protein  48.97 
 
 		 244 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0796  hypothetical protein  53.04 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1334  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3325  beta-lactamase domain-containing protein  47.11 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  32.05 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  32.62 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  30.33 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.27 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1685  beta-lactamase domain-containing protein  29.87 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.0000313983  hitchhiker  0.00000630033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0184  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.24 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3962  beta-lactamase domain-containing protein  32.35 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17682  normal  0.145859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1103  beta-lactamase domain-containing protein  31.6 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  29.84 
 
 		 322 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  28.38 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0350  ribonuclease Z  31.87 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2251  beta-lactamase-like  29.81 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174345  normal  0.0139422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2357  beta-lactamase-like protein  30.04 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  28.44 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1910  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.405245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  28.8 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3244  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.59 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  27.31 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  30.86 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1316  beta-lactamase domain-containing protein  28.68 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4288  beta-lactamase-like protein  29.91 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  31.39 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0761  beta-lactamase domain protein  23.65 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3172  beta-lactamase superfamily hydrolase  29.21 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  30.51 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  35.62 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  29.19 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1359  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  27.43 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  27.59 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.26 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  25.81 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1324  hypothetical protein  31.58 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.588841  hitchhiker  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  29.87 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  26.21 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  28.16 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  26.28 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6632  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.32 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  29.28 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  25.33 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1126  beta-lactamase domain protein  20.87 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0125591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2093  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  26.43 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  27.62 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  25.68 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  33.06 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.41 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1470  metal-dependent hydrolase  26.29 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.518111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  31.21 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  23.83 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0838  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1973  ribonuclease Z  33.55 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0417  ribonuclease Z  33.8 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1897  beta-lactamase domain-containing protein  26.84 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  27.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1951  ribonuclease Z  34.38 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00782694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  25.35 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2314  hypothetical protein  28.85 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  26.35 
 
 		 312 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  27.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  27.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09930  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  26.56 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.65106  normal  0.185671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  27.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  26.88 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  27.43 
 
 		 312 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  62  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3845  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3919  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3831  beta-lactamase domain-containing protein  28.33 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.196272 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  26.98 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1188  hypothetical protein  21.68 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1229  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  28.99 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2582  hypothetical protein  29.33 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0810  hypothetical protein  24.27 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  28.02 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4186  metallo-beta-lactamase family protein  22.57 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.167335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>