23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8807 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6116  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8807  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8596  hypothetical protein  91.07 
 
 
112 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7624  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0759  hypothetical protein  61.19 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2733  hypothetical protein  62.86 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3495  hypothetical protein  68.25 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1098  hypothetical protein  66.67 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  0.172733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1692  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  67.8 
 
 
181 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.670571 
 
 
-
 
NC_004310  BR0633  hypothetical protein  60.87 
 
 
216 aa  87.8  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0836071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0628  hypothetical protein  60.87 
 
 
216 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0799626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0740  hypothetical protein  62.3 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0803739  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0599  hypothetical protein  61.9 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1625  putative signal peptide  64.41 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400515  normal  0.104398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2682  hypothetical protein  55.22 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6738  hypothetical protein  74.19 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.056073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3738  hypothetical protein  61.02 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571192  normal  0.0272563 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2650  hypothetical protein  55.07 
 
 
274 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384111  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0494  hypothetical protein  47.42 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.690027  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0331  hypothetical protein  59.32 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.740068  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0544  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  46.43 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0625  hypothetical protein  55 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6170  hypothetical protein  61.82 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>