21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8799 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8799    100 
 
 		 417 bp  827    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.806351  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8454  transposase and inactivated derivatives-like protein  100 
 
 		 504 bp  827    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.5 
 
 		 947 bp  103  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.21 
 
 		 944 bp  83.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3938    84 
 
 		 276 bp  71.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4162    86.25 
 
 		 567 bp  71.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  83.5 
 
 		 567 bp  69.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4038  ISSpo6, transposase OrfB  97.37 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3762  ISSpo6, transposase OrfB  97.37 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178592  normal  0.256949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3398  ISSpo6  97.37 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2246  hypothetical protein  97.37 
 
 		 531 bp  67.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.937178 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  91.11 
 
 		 507 bp  58  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  91.11 
 
 		 348 bp  58  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0479  hypothetical protein  90.91 
 
 		 958 bp  56  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.149422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0288    90.48 
 
 		 606 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  90.48 
 
 		 399 bp  52  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  90.24 
 
 		 947 bp  50.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2333    91.67 
 
 		 943 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32330  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  84.38 
 
 		 309 bp  48.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  84.75 
 
 		 477 bp  46.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  84.75 
 
 		 477 bp  46.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>