More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8771 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
226 aa  451  1e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  58.41 
 
 
224 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3579  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  47.71 
 
 
227 aa  201  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.299225  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5433  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  46.98 
 
 
228 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4687  ParA protein, putative  38.05 
 
 
228 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4349  ParA protein, putative  38.05 
 
 
228 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108838  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0061  parA protein, putative  37.61 
 
 
228 aa  155  5e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0653211  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2810  ParA protein, putative  39.53 
 
 
231 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0568831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  39.29 
 
 
252 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0283  putative partition protein ParA  37.96 
 
 
228 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  37.9 
 
 
219 aa  138  8e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5170  ParA protein, putative  32.39 
 
 
260 aa  130  2e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.433255  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.28 
 
 
232 aa  129  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2127  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.16 
 
 
238 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.196081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.88 
 
 
237 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2944  ParA chromosome partitioning protein  37.16 
 
 
238 aa  120  2e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5278  stability/partitioning determinant  30.77 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.918296  normal 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  31.46 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.8 
 
 
251 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.11 
 
 
209 aa  80.9  1e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4271  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.71 
 
 
229 aa  80.1  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.323978  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  27.88 
 
 
228 aa  75.1  9e-13  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  27.04 
 
 
241 aa  72.4  6e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.02 
 
 
209 aa  68.6  8e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  26.8 
 
 
207 aa  68.2  9e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 
212 aa  68.2  1e-10  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  26.46 
 
 
222 aa  67.8  1e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 
214 aa  67.8  1e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.75 
 
 
222 aa  67.4  2e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  27.81 
 
 
231 aa  67  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29 
 
 
209 aa  65.1  9e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 
217 aa  64.3  1e-09  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.64 
 
 
217 aa  64.3  1e-09  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5279  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.82 
 
 
213 aa  64.7  1e-09  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 
209 aa  63.2  3e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4151  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.43 
 
 
220 aa  63.5  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  26.24 
 
 
237 aa  62.8  4e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3901  virC1 gene, ATPase  26.7 
 
 
298 aa  62.8  4e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691953  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
211 aa  62.4  6e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
220 aa  62.4  6e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3028  putative partition protein ParA  28.79 
 
 
220 aa  62.4  6e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.07 
 
 
217 aa  61.6  9e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.6  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.40311e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3162  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 
220 aa  61.2  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00230734  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.6  1e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.2  1e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0144325  hitchhiker  0.00132675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5166  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.2  1e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0700383  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.41 
 
 
220 aa  61.2  1e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.6 
 
 
232 aa  61.2  1e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  1.16025e-11  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2371  ParA family protein  26.9 
 
 
220 aa  60.8  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00259605  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 
220 aa  60.5  2e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 
219 aa  60.1  3e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.73 
 
 
217 aa  58.9  6e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.84 
 
 
207 aa  58.9  6e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.6 
 
 
212 aa  58.5  8e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
217 aa  58.2  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
242 aa  57.8  1e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37688  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  29.77 
 
 
210 aa  58.2  1e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.12 
 
 
217 aa  58.2  1e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.41933e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.73 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  6.61225e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
217 aa  57  2e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.46 
 
 
217 aa  57.8  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0912  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.47 
 
 
216 aa  57.4  2e-07  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.42 
 
 
217 aa  57.4  2e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  27.41 
 
 
220 aa  57.4  2e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  1.97714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.79 
 
 
212 aa  56.6  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6002  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.34 
 
 
231 aa  57  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.743833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  32.76 
 
 
250 aa  56.6  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5758  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.34 
 
 
231 aa  57  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.713323  normal  0.732786 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 
216 aa  56.2  4e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.85 
 
 
212 aa  56.2  4e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493371  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7737  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.27 
 
 
209 aa  55.8  5e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
212 aa  55.8  5e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6193  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.89 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.220398 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6670  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.89 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.734971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6160  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.89 
 
 
231 aa  55.8  5e-07  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135361 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 
232 aa  55.5  6e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  26.42 
 
 
237 aa  55.5  6e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 
232 aa  55.5  6e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.71 
 
 
217 aa  55.5  7e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
216 aa  55.5  7e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.25 
 
 
215 aa  54.3  1e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  26.09 
 
 
233 aa  55.1  1e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0850  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
219 aa  54.7  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668174  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 
211 aa  54.3  1e-06  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 
212 aa  55.1  1e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  24.23 
 
 
233 aa  54.7  1e-06  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.03 
 
 
217 aa  54.3  2e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 
215 aa  53.9  2e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  24.43 
 
 
222 aa  54.3  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0391  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.17 
 
 
264 aa  54.3  2e-06  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.18454e-07  unclonable  4.58103e-10 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>