35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8763 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  35.35 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  33.63 
 
 		 249 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6694  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2033  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 672 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.593414  hitchhiker  0.00610448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  31.56 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  25.23 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 262 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  27.88 
 
 		 248 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  24.34 
 
 		 557 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  26.05 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.18 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  27.08 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.93 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.88 
 
 		 239 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1462  Methyltransferase type 12  31.51 
 
 		 434 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>