More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8721 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
242 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  77.27 
 
 
246 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  79.31 
 
 
245 aa  348  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.11 
 
 
248 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  59.26 
 
 
242 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  57.59 
 
 
248 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.26 
 
 
242 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.72 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.82 
 
 
268 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.45 
 
 
223 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.44 
 
 
249 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.39 
 
 
236 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.89 
 
 
243 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.94 
 
 
1314 aa  106  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.63 
 
 
257 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.71 
 
 
238 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.49 
 
 
254 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.1 
 
 
1055 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  39.92 
 
 
248 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  36.36 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.15 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.32 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.98 
 
 
1051 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30 
 
 
1051 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.58 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.22 
 
 
262 aa  95.9  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.28 
 
 
1053 aa  95.1  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.29 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.12 
 
 
1053 aa  94.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.04 
 
 
1052 aa  94.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.45 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.74 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.51 
 
 
1050 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.4 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.02 
 
 
260 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  35.22 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.16 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.77 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.83 
 
 
456 aa  92.4  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.6 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.02 
 
 
243 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31 
 
 
456 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.83 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  36.22 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.73 
 
 
525 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.39 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.64 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.12 
 
 
244 aa  89  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.64 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  32.38 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.57 
 
 
456 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.77 
 
 
1053 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.66 
 
 
215 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.28 
 
 
396 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  30 
 
 
227 aa  84.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.5 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.21 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.06 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.59 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.14 
 
 
1125 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.78 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  32.33 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.74 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.05 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.47 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.99 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.76 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.86 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.29 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1156  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0666674  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.9 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.84 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.525568  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.72 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.99 
 
 
1088 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.88 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.55 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.86 
 
 
212 aa  72  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  31.67 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  29.28 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  32.49 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0861  HAD superfamily hydrolase  32.31 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3750  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.773366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  37.61 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  42.53 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  29.28 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  28.28 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0852  HAD superfamily hydrolase  32.31 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  27.8 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  30 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.14 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  30.18 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>