85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8678 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8678  cytochrome c class I  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5874  cytochrome c class I  74.86 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362058  normal  0.18158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4887  putative cytochrome c region protein  62.2 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7231  cytochrome c class I  61.8 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3665  cytochrome c, class I  63.98 
 
 		 194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3340  cytochrome c, class I  63.35 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1895  putative cytochrome c  66 
 
 		 181 aa  207  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2167  putative sulfite oxidase cytochrome c subunit, SoxD  64.47 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1239  cytochrome c, class I  66.47 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6593  cytochrome c, class I  66.47 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0152  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  62.82 
 
 		 195 aa  205  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6197  cytochrome c class I  69.66 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3042  cytochrome c, class I  54.04 
 
 		 259 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3677  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  50.6 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0147  cytochrome c, class I  55.19 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1517  putative cytochrome  50.32 
 
 		 260 aa  164  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.936874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4162  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  51.25 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  50.59 
 
 		 342 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3211  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  49.02 
 
 		 206 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4956  putative sulfite oxidase cytochrome subunit (SoxD)  48.43 
 
 		 251 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1616  cytochrome c class I  49.01 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.986895 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  46.58 
 
 		 382 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2087  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  49.3 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0912  putative sulfite oxidase cytochrome subunit  54.14 
 
 		 202 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.68088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1094  cytochrome c, class I  46.5 
 
 		 188 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4251  putative cytochrome  47.68 
 
 		 242 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.460774  normal  0.218955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3912  hypothetical protein  48.98 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.411473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4367  cytochrome c, class I  46.54 
 
 		 243 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0341  putative cytochrome c, class I precursor  46.55 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2437  diheme cytochrome c SoxD  45.11 
 
 		 355 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2987  cytochrome c, class I  41.4 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1590  cytochrome c class I  50.32 
 
 		 344 aa  134  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0560  sulfite oxidase cytochrome subunit  37.37 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2734  cytochrome c class I  44.59 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.207547  hitchhiker  0.0000919605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3257  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 344 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.225415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2868  cytochrome c class I  44.81 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1666  cytochrome c class I  49.02 
 
 		 344 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2285  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 346 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00711214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3133  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 348 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0802  cytochrome c, class I  40.86 
 
 		 360 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.641735  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2059  diheme cytochrome c SoxD  45.86 
 
 		 382 aa  124  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173988  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  42.77 
 
 		 355 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 404 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0586  hypothetical protein  36.9 
 
 		 239 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.649014  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3444  hypothetical protein  37.97 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3203  Mo-co oxidoreductase dimerization domain protein  37.97 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.595677  hitchhiker  0.0000523602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  98.6  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000097536  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  39.18 
 
 		 678 aa  58.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2891  cytochrome c, class I  36.26 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1739  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  32.93 
 
 		 347 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1569  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.832933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 304 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  31.86 
 
 		 304 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  31.86 
 
 		 304 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 310 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.44 
 
 		 447 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  30.97 
 
 		 304 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  31.67 
 
 		 285 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6161  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 424 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7193  cytochrome c class I  28.16 
 
 		 409 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  0.500209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5894  cytochrome c class I  30.68 
 
 		 421 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  23.44 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5127  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3241  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 415 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0294244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5154  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 401 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5973  cytochrome c class I  31.46 
 
 		 412 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0365316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  28.7 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.81 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  29.81 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  32.98 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4251  cytochrome c class I  29.2 
 
 		 286 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0839506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.03 
 
 		 355 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 272 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  29.53 
 
 		 275 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  33.03 
 
 		 269 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  37.63 
 
 		 419 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  45.24 
 
 		 123 aa  41.6  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  29.66 
 
 		 318 aa  41.2  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  37.21 
 
 		 430 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2798  cytochrome c, class I  30.95 
 
 		 410 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 353 aa  41.2  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>