More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8642 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  76.02 
 
 		 444 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 453 aa  905    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  58.28 
 
 		 493 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  54.74 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  48.37 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  48.29 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  47.61 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  47.58 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  49.06 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  45.94 
 
 		 459 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 477 aa  361  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 457 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 457 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  44.29 
 
 		 457 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 406 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.92 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  41.95 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.17 
 
 		 430 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 440 aa  286  7e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.74 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  37.56 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 445 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 435 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.56 
 
 		 433 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 445 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.56 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  36.34 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.08 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40 
 
 		 437 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  39.06 
 
 		 443 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.63 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.84 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  36.84 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.96 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  35.81 
 
 		 437 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.65 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 442 aa  270  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.99 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.24 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.24 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 439 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.24 
 
 		 438 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.47 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2766  permease of the major facilitator superfamily  40.25 
 
 		 427 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0928432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.17 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  36.23 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.9 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 439 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  38 
 
 		 433 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.34 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.34 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.34 
 
 		 461 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  36.36 
 
 		 439 aa  266  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 439 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.08 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 437 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  37.5 
 
 		 438 aa  263  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 437 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  35.98 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.65 
 
 		 452 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  39.35 
 
 		 442 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  35.98 
 
 		 435 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  35.42 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>