More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8629 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 220 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 218 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  35.71 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0838  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0913555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  31.07 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0010  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  hitchhiker  0.00449189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  26.44 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2985  HTH-type transcriptional regulator  36.49 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3677  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0509  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.137799 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  37.14 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2731  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000186795  normal  0.0139063 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6551  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0264715  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1526  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.625253  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.16 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  33.52 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  29.21 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0093  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  26.64 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3386  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.020999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1351  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1526  transcriptional regulator, GntR family  42.31 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000364413 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4140  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0981  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2641  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  24.14 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>