123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8572 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  53.24 
 
 
295 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  50.36 
 
 
285 aa  258  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  49.31 
 
 
295 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  50 
 
 
288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  50.35 
 
 
297 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  50.35 
 
 
297 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  47.86 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.4 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  46.89 
 
 
295 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  49.41 
 
 
278 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  45.49 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  48.25 
 
 
295 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  48.25 
 
 
295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  48.6 
 
 
295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  45.23 
 
 
295 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  56.88 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  50.73 
 
 
300 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.04 
 
 
296 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
295 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
295 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.88 
 
 
295 aa  221  9e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
295 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
295 aa  221  9e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  44.88 
 
 
295 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  44.88 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  47.55 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  44.69 
 
 
293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49 
 
 
285 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  51.49 
 
 
283 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  45.32 
 
 
305 aa  215  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  46.44 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  46.64 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  46.64 
 
 
295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  46.29 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  46.29 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  45.76 
 
 
295 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.1 
 
 
291 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  44.8 
 
 
295 aa  208  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  46.27 
 
 
314 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  46.29 
 
 
286 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  46.47 
 
 
299 aa  205  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  44.87 
 
 
295 aa  202  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  45.32 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  44.87 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  44.87 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  48.15 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.9 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.32 
 
 
288 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  44.44 
 
 
292 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  42.45 
 
 
290 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.29 
 
 
282 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  47.97 
 
 
301 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  42.65 
 
 
295 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.29 
 
 
293 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  42.8 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.18 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  50.72 
 
 
303 aa  177  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  44.91 
 
 
295 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  37.55 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  38.3 
 
 
358 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  43.17 
 
 
290 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.49 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  41.22 
 
 
305 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  40.15 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.55 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  38.1 
 
 
296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  37.87 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  38.93 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  39.11 
 
 
283 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.28 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.21 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.1 
 
 
325 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.39 
 
 
315 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  37.12 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.25 
 
 
305 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  34.82 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  34.82 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  34.82 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.71 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  32.81 
 
 
306 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  32.99 
 
 
288 aa  102  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  38.05 
 
 
293 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  32.53 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 
314 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  40.3 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  33.71 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1520  hypothetical protein  30.04 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.0966984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2007  hypothetical protein  30.45 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.965674  normal  0.319686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  35.08 
 
 
277 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  33.46 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  24.67 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2543  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  0.409771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>