More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8525 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8525  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 522 aa  1027    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1314  SSS sodium solute transporter superfamily  91.19 
 
 		 522 aa  887    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1155  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  91.38 
 
 		 522 aa  889    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.409917  normal  0.213123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  59.38 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  58.71 
 
 		 519 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  56.05 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.77 
 
 		 541 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  55.38 
 
 		 541 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  55.38 
 
 		 541 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  55.91 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  55.4 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  51.98 
 
 		 577 aa  505  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  54.69 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  52.78 
 
 		 554 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  51.94 
 
 		 563 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  52.49 
 
 		 552 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  53.19 
 
 		 554 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  52.32 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3960  acetate permease  51.06 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.221467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5572  acetate permease  51.06 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  52.99 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4622  acetate permease  51.06 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  51.06 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4619  acetate permease  50.86 
 
 		 549 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4529  acetate permease  51.06 
 
 		 549 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  51.06 
 
 		 550 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03939  acetate permease  50.86 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.68156  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3925  cation/acetate symporter ActP  50.86 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4533  acetate permease  50.67 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.612121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  51.89 
 
 		 552 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03899  hypothetical protein  50.86 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.790578  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3262  acetate permease  50.1 
 
 		 552 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4668  acetate permease  50.67 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.962936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4586  acetate permease  50.86 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  50.58 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  50.58 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  50.58 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4617  acetate permease  50.67 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825598  normal  0.309264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  52.25 
 
 		 551 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  51.82 
 
 		 554 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  52.36 
 
 		 552 aa  481  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  52.59 
 
 		 554 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4526  acetate permease  50.67 
 
 		 549 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  54.39 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  52.49 
 
 		 544 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  52.05 
 
 		 551 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  53.88 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  50.79 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  50.19 
 
 		 552 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  52.91 
 
 		 552 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  53.91 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  53.88 
 
 		 520 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  50.19 
 
 		 552 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5873  acetate permease  53.97 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3743  acetate permease  52.57 
 
 		 554 aa  472  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0101501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  50.92 
 
 		 576 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0274  acetate permease  51.45 
 
 		 549 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0721182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.85 
 
 		 560 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50 
 
 		 575 aa  469  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35030  cation/acetate symporter ActP  50.85 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.89065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  52.35 
 
 		 576 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  50.55 
 
 		 577 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  52.35 
 
 		 576 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6216  acetate permease  53.48 
 
 		 564 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  51.61 
 
 		 666 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2954  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.22 
 
 		 563 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0772192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  51.42 
 
 		 553 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5644  Na+/solute symporter  51.1 
 
 		 545 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.439456  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2885  acetate permease  51.22 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.360969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2260  acetate permease  51.22 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.081454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  51.05 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2874  acetate permease  51.22 
 
 		 561 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  49.53 
 
 		 574 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  49.35 
 
 		 572 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  51.04 
 
 		 553 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5210  SSS sodium solute transporter superfamily  52.93 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4785  SSS sodium solute transporter superfamily  52.93 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2791  acetate permease  51.04 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.836123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2929  acetate permease  51.04 
 
 		 561 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.04 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  47.5 
 
 		 513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2787  SSS sodium solute transporter superfamily  49.25 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  46.52 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  51.39 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  46.52 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2564  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.25 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.868226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  51.43 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.6 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  49.91 
 
 		 577 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  49.91 
 
 		 571 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  46.52 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  46.32 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0428  Na+/solute symporter  48.68 
 
 		 559 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00400759  decreased coverage  0.0000917486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  47.48 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  46.32 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  46.32 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  49.62 
 
 		 561 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  46.32 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  46.32 
 
 		 516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3160  SSS sodium solute transporter superfamily  52.01 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>