More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8499 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8499  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 342 aa  705    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  38.48 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2392  helix-turn-helix domain-containing protein  36.81 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1134  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.955983  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  28.06 
 
 		 335 aa  125  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1998  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 334 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3195  Fis family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 346 aa  119  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  26.36 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  28.67 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  27.7 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 343 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2605  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.384933  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  24.06 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  26.45 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  24.62 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2412  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 386 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.462091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  24.62 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  25.41 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  25.78 
 
 		 365 aa  92.8  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1709  Fis family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.839551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  26.84 
 
 		 366 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2470  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  26.07 
 
 		 348 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  28.66 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2143  transcriptional regulator, AraC family  25.85 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  0.883029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 198 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 350 aa  89.4  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  25.08 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  25.39 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  23.27 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  26.51 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 342 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  24.25 
 
 		 396 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 346 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 343 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  21.01 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1451  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.508698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2560  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.480763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  25.24 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  24.32 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6811  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  23.84 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4184  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal  0.842889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  27.27 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16430  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  24.16 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>