64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8339 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8339  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  100 
 
 		 240 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6142  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  70.17 
 
 		 239 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2727  putative 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  39.5 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.640085  normal  0.18578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2883  deaminase-reductase domain-containing protein  43.46 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.154582  normal  0.528323 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4269  deaminase-reductase domain-containing protein  39.24 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784673  normal  0.386339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.24 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.4 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.650924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4398  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.25 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0716  putative pyrimidine reductase  38.98 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.456218 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3284  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.7 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.75 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.511472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3358  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.49 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3920  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.98 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1915  deaminase-reductase domain-containing protein  30.08 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03960  pyrimidine reductase, riboflavin biosynthesis  30.77 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.01 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1843  deaminase-reductase domain-containing protein  28.79 
 
 		 329 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.53223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1048  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  24.37 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1398  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.53 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0446  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino) uracil reductase  29.41 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1919  hypothetical protein  38.89 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0593  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  32.43 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.075481  normal  0.240855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1325  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  29.03 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.264081  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0416  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  23.43 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0230  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.53 
 
 		 360 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0226  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  25 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000414817  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0908  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  34.44 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000531034 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0660  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  23.65 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00276533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2094  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.56 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1890  riboflavin biosynthesis protein RibD  24.54 
 
 		 366 aa  50.1  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.22105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1222  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  36.71 
 
 		 367 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1523  riboflavin biosynthesis protein RibD  21.74 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.383739  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0804  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  28.99 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.301306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0604  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  27.69 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0843  riboflavin biosynthesis protein RibD  27.75 
 
 		 363 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2490  hypothetical protein  36.08 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380096 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5200  2,5-diamino-6-hydroxy-4-(5- phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  34.26 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.63994  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1445  riboflavin biosynthesis protein RibD  37.8 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0937  2, 5-diamino-6-(5-phosphoribosylamino)pyrimidin-4(3H)-one reductase  26.75 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0807982 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0643  hypothetical protein  28.95 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0103  riboflavin-specific deaminase  24.24 
 
 		 396 aa  45.8  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1982  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.18 
 
 		 370 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3397  riboflavin biosynthesis protein RibD  34.38 
 
 		 367 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2731  riboflavin biosynthesis protein RibD  36.51 
 
 		 401 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2228  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.86 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0584067  normal  0.0428957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1688  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.97 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1352  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.95 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0644907 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0021  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00371896 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0152  riboflavin biosynthesis protein (diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase (riboflavin-specific deaminase) and 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase)  32.81 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0067  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  25.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.679825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2620  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.26 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.146341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0659  bifunctional RNAse/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  30.95 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1313  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  27.1 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0807  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.94 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185302  normal  0.290078 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0026  dihydrofolate reductase region  37.66 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000208627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3096  riboflavin biosynthesis protein; diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase  32.81 
 
 		 367 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3078  2, 5-diamino-6-hydroxy-4-(5-phosphoribosylamino)pyrimidine 1-reductase  30.33 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.62381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0543  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  26.45 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0940433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4050  riboflavin biosynthesis protein RibD  28.86 
 
 		 384 aa  42.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0876  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  31.36 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.225628  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1122  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.93 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.858422 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1742  5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  38.81 
 
 		 217 aa  42  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0665302 
 
 
-
 
NC_002978  WD0710  riboflavin biosynthesis protein RibD  21.61 
 
 		 360 aa  41.6  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07090  diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase /5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase  33.33 
 
 		 371 aa  41.6  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.312982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>