32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8331 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  338  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  69.64 
 
 
167 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  65.49 
 
 
147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  51.68 
 
 
165 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  57.66 
 
 
177 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  55.86 
 
 
173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  54.87 
 
 
169 aa  130  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  57.94 
 
 
118 aa  124  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  46.25 
 
 
171 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  56.38 
 
 
118 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  47.58 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  49.06 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  44.74 
 
 
116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  45.92 
 
 
142 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  46.9 
 
 
118 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  40.94 
 
 
156 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  45.83 
 
 
124 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  41.94 
 
 
327 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  44.68 
 
 
197 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  35.66 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  34.38 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  28.19 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  37.07 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  37.17 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  33.04 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  41.94 
 
 
113 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  32.2 
 
 
156 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  40.96 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  41.33 
 
 
179 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3400  hypothetical protein  59.26 
 
 
60 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  51.2  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>