137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8329 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  82.44 
 
 		 131 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  81.4 
 
 		 131 aa  221  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  78.29 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.97 
 
 		 131 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  73.08 
 
 		 131 aa  208  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.42 
 
 		 131 aa  206  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  72.52 
 
 		 132 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.76 
 
 		 132 aa  203  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  75.76 
 
 		 132 aa  203  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.09 
 
 		 131 aa  202  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.54 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.32 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.87 
 
 		 131 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  73.64 
 
 		 135 aa  198  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  73.64 
 
 		 134 aa  196  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  74.42 
 
 		 133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  71.32 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  71.32 
 
 		 136 aa  192  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  69.77 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  72.09 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  70.54 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  70.54 
 
 		 131 aa  190  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  71.32 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  70.54 
 
 		 136 aa  190  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  68.99 
 
 		 132 aa  189  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  70 
 
 		 131 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  67.63 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.69 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.23 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  64.96 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  68.22 
 
 		 134 aa  183  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.77 
 
 		 164 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  65.12 
 
 		 387 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  68.22 
 
 		 156 aa  180  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.99 
 
 		 157 aa  176  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.91 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 		 132 aa  175  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.67 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.66 
 
 		 133 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.57 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  61.48 
 
 		 136 aa  173  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  64.34 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.08 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  60.45 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  64.34 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  65.04 
 
 		 298 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  62.02 
 
 		 276 aa  166  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.62 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  59.69 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  58.14 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  59.54 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  59.69 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  58.46 
 
 		 135 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.38 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  54.89 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.12 
 
 		 135 aa  156  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  57.03 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  54.69 
 
 		 167 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  60.16 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  60.16 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  52.63 
 
 		 133 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  56.59 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.98 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  56.59 
 
 		 158 aa  150  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 		 219 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  59.35 
 
 		 156 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  54.69 
 
 		 157 aa  146  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  52.67 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  56.06 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.08 
 
 		 398 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  55.81 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  53.78 
 
 		 396 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  57.36 
 
 		 403 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  53.6 
 
 		 170 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  64.08 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  52.8 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  52.31 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.06 
 
 		 174 aa  126  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  50.83 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  47.69 
 
 		 238 aa  125  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.03 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.14 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.45 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  44.62 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  51.64 
 
 		 268 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.67 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  47.2 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  52.07 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.61 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.41 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  43.36 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  43.2 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  41.48 
 
 		 139 aa  100  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 260 aa  100  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  44.7 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>