More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8319 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  92.13 
 
 
306 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  90.82 
 
 
306 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  69.18 
 
 
307 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  68.63 
 
 
307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  55.78 
 
 
304 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.93 
 
 
318 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.93 
 
 
318 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.43 
 
 
313 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  54.67 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  54.67 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  55 
 
 
309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  53.16 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  51.32 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.81 
 
 
307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  53.85 
 
 
307 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.7 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.7 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  49.33 
 
 
323 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00220  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, putative  40.43 
 
 
594 aa  133  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.97 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6274  gluconolactonase  29.25 
 
 
308 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  29.77 
 
 
280 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  29.39 
 
 
287 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2283  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.49 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492267 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.79 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  30.25 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4144  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1903  gluconolactonase precursor  28.57 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3465  senescence marker protein-30 (SMP-30)  28.81 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.02 
 
 
302 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  28.63 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2118  putative gluconolactonase precursor  29.7 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0176891  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2253  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.89 
 
 
307 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.88 
 
 
307 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3148  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.4 
 
 
303 aa  88.2  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.298664 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3389  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.3 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1244  strictosidine synthase  31.4 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205985  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1217  strictosidine synthase  31.16 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.908718  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.31 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.31 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1234  strictosidine synthase  31.16 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36412  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  28.57 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0871  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.66 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3295  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.39 
 
 
579 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1696  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.8 
 
 
346 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  28.78 
 
 
324 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.46 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  28.46 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2953  gluconolactonase  29.09 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  26.94 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  28.78 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.03 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  27.53 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0864  gluconolactonase, putative  27.4 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.97906  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.86 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04622  gluconolactonase  28.2 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  26.01 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.8 
 
 
581 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  28.03 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  30.62 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  27.21 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  28.69 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  29.01 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.8 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2681  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.6 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.8 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5077  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.57 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167981  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.73 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  27.44 
 
 
334 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.53 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  26.28 
 
 
352 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.64 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1529  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.28 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  26.52 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.03 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  26.04 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  27.88 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  26.32 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  28.57 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  26.19 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.79 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  23.51 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  27.51 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  28.44 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  28.37 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  26.2 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  24.29 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  25.09 
 
 
545 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3322  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.67 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.13 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  27.5 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.09 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  27.42 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  29.3 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  25.72 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  28.03 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3700  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.26 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>