289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8313 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  100 
 
 
491 aa  961    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  30.93 
 
 
489 aa  237  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  31.38 
 
 
518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  32.22 
 
 
478 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  30.74 
 
 
489 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  31.63 
 
 
510 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  32.16 
 
 
493 aa  209  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  30.82 
 
 
507 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  31.31 
 
 
517 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  31.31 
 
 
517 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  30.94 
 
 
568 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  33.33 
 
 
526 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  30.77 
 
 
505 aa  170  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  27.23 
 
 
533 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  27.16 
 
 
466 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  31.41 
 
 
451 aa  153  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  26.56 
 
 
532 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  30.66 
 
 
483 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  30.36 
 
 
483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  27.66 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.7 
 
 
486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  27.83 
 
 
521 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  28.51 
 
 
491 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  28.17 
 
 
501 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.23 
 
 
473 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  27.61 
 
 
470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  27.95 
 
 
492 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  26.17 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  26.17 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.03 
 
 
446 aa  134  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  29.42 
 
 
482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  26.95 
 
 
488 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  29.34 
 
 
487 aa  134  5e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  27.97 
 
 
540 aa  133  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  27.57 
 
 
607 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.96 
 
 
476 aa  131  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.53 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  27.98 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.85 
 
 
459 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  28.35 
 
 
455 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.33 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  25.67 
 
 
483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  28.16 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  28.81 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  27.17 
 
 
467 aa  128  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  29.56 
 
 
522 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.33 
 
 
456 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  26.87 
 
 
501 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.54 
 
 
516 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  29.3 
 
 
557 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  27.66 
 
 
490 aa  124  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  26.65 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  23.89 
 
 
517 aa  121  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  29.68 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  27.62 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  26.32 
 
 
502 aa  120  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.82 
 
 
453 aa  120  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  28.02 
 
 
466 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  27.42 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  27.78 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  27.79 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  27.78 
 
 
466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  24.64 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  26.75 
 
 
520 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  26.75 
 
 
520 aa  118  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  27.47 
 
 
490 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  28.41 
 
 
506 aa  117  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  26.28 
 
 
475 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  27.15 
 
 
461 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  28.45 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  28.6 
 
 
490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.17 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.21 
 
 
466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  29.17 
 
 
499 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  27.03 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  27.03 
 
 
501 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  24.79 
 
 
476 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  31.79 
 
 
485 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  25 
 
 
456 aa  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  26.12 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  27.21 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  30.69 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  28.23 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  27.78 
 
 
482 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  28.23 
 
 
477 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.95 
 
 
660 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  27.74 
 
 
464 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  28.02 
 
 
477 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  28.98 
 
 
516 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  25.77 
 
 
474 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  28.02 
 
 
477 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  26.46 
 
 
473 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  28.02 
 
 
477 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  28.02 
 
 
477 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  24.49 
 
 
483 aa  108  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  25.84 
 
 
471 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>