More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8311 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  70.19 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  68.01 
 
 		 282 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  67.3 
 
 		 284 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  67.3 
 
 		 284 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  65.56 
 
 		 274 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  64.06 
 
 		 254 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  64.17 
 
 		 255 aa  318  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  54.44 
 
 		 289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  55.85 
 
 		 275 aa  264  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  31.92 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  31.42 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  33.47 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  29.63 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  32.68 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  32.73 
 
 		 240 aa  95.5  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  26.97 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  28.74 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  33.19 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  33.19 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  29.46 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  30.8 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  34.03 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  32.16 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  31.91 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  31.23 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  28.1 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.34 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1572  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.38 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.87 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.92 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  27.73 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  28.05 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  26.15 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  26.17 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  27.11 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.24 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  30.21 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  30.26 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  30.26 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  26.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  29.05 
 
 		 389 aa  72.4  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.7 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  32.75 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  30.6 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  29.92 
 
 		 380 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4146  citrate (Si)-synthase  33.05 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  29.87 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  30.38 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  30.38 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  30.97 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0398  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.38 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0419831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  29.38 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  24.55 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  24.55 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  29.49 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.11 
 
 		 610 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  23.35 
 
 		 610 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.35 
 
 		 610 aa  69.3  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  32.49 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  28.94 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2103  citrate synthase 2  31.6 
 
 		 364 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  28.51 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  28.51 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  28.51 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  28.51 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  28.51 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.73 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  28.51 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  33.19 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  28.51 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  22.91 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  28.51 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  30.8 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  28.95 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  28.51 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  29.19 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.95 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  29.03 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0281  citrate synthase  26.03 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.160338  normal  0.143922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  30.21 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  30.14 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  29.63 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2376  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.151245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  30.59 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  26.76 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2401  2-methylcitrate synthase  27.76 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.612256  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  29.63 
 
 		 381 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1487  2-methylcitrate synthase  28.82 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1252  Citrate (Si)-synthase  30.95 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.67 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1062  citrate lyase, subunit 2  22.03 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.39 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>