More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8307 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  56.96 
 
 		 547 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  56.96 
 
 		 547 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  57.9 
 
 		 547 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  61.4 
 
 		 552 aa  708    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  56.96 
 
 		 547 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  57.14 
 
 		 547 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  59.15 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  57.14 
 
 		 547 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  59.15 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  58.47 
 
 		 550 aa  648    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  59.59 
 
 		 556 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  75 
 
 		 565 aa  816    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  57.86 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  56.96 
 
 		 547 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  59.33 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  78.75 
 
 		 551 aa  886    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  59.15 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  57.86 
 
 		 546 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  92.55 
 
 		 554 aa  1030    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  59.01 
 
 		 558 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  59.15 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  59.52 
 
 		 546 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  72.11 
 
 		 548 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  58.29 
 
 		 550 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  78.36 
 
 		 550 aa  859    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  57.86 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  59.33 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  71.88 
 
 		 546 aa  798    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  100 
 
 		 552 aa  1118    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  59.33 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  58.04 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  57.86 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  58.93 
 
 		 550 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  58.23 
 
 		 546 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  57.69 
 
 		 547 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  56.2 
 
 		 547 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  57.86 
 
 		 546 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  55.88 
 
 		 546 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  56.59 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  56.78 
 
 		 547 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  57.19 
 
 		 546 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  52.3 
 
 		 550 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  53.2 
 
 		 548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  57.72 
 
 		 547 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  52.72 
 
 		 563 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  48.79 
 
 		 544 aa  526  1e-148  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  41.24 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  44.07 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  42.91 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  42.91 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  41.94 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  43.02 
 
 		 547 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  42.88 
 
 		 547 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  40.19 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  40 
 
 		 544 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  41.78 
 
 		 547 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  40.93 
 
 		 583 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.56 
 
 		 554 aa  365  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  36.21 
 
 		 547 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  38.04 
 
 		 583 aa  352  1e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.48 
 
 		 526 aa  323  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  34.69 
 
 		 559 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  32.6 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  33.39 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  33.39 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  33.39 
 
 		 562 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  34.24 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  32.6 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  32.42 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  32.42 
 
 		 565 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  32.66 
 
 		 565 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  32.42 
 
 		 565 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  34.36 
 
 		 548 aa  299  8e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  32.67 
 
 		 562 aa  299  9e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  32.6 
 
 		 559 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  33.82 
 
 		 567 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  32.91 
 
 		 559 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  35.54 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  32.29 
 
 		 567 aa  293  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  32.84 
 
 		 559 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  33.82 
 
 		 561 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  33.63 
 
 		 562 aa  280  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34 
 
 		 563 aa  277  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.38 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  31.07 
 
 		 558 aa  269  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.65 
 
 		 563 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.4 
 
 		 581 aa  266  8e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.97 
 
 		 562 aa  266  8e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.83 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  31.57 
 
 		 559 aa  263  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  30.3 
 
 		 554 aa  262  8.999999999999999e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.94 
 
 		 582 aa  263  8.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  29.81 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  29.81 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1703  acetolactate synthase  31 
 
 		 560 aa  262  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.694647  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  31.88 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  31.44 
 
 		 560 aa  261  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  29.38 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>