38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8305 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8430    97.19 
 
 
1348 bp  2375    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8413    99.93 
 
 
1353 bp  2668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8305    100 
 
 
1350 bp  2676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6370    84.28 
 
 
1374 bp  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8297    100 
 
 
156 bp  309  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0126117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  79.97 
 
 
1377 bp  289  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  84.89 
 
 
1383 bp  270  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  82.48 
 
 
1374 bp  147  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  82.48 
 
 
1374 bp  147  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  82.48 
 
 
1374 bp  147  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  82.48 
 
 
1374 bp  147  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  83.41 
 
 
675 bp  125  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0820    87.16 
 
 
572 bp  105  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0754494  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  82.02 
 
 
1383 bp  99.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5947    82.17 
 
 
1382 bp  81.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.123612 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  80.95 
 
 
1353 bp  69.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  80.95 
 
 
1353 bp  69.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  80.95 
 
 
1353 bp  69.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  88.14 
 
 
1383 bp  61.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  88.14 
 
 
1383 bp  61.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  88.14 
 
 
1383 bp  61.9  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  81.82 
 
 
1377 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  81.82 
 
 
1377 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1990  transposase and inactivated derivative  82.11 
 
 
180 bp  54  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00339678  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
1281 bp  54  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  92.11 
 
 
1674 bp  52  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  92.11 
 
 
1644 bp  52  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  92.11 
 
 
1674 bp  52  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  100 
 
 
945 bp  48.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  100 
 
 
1488 bp  48.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  100 
 
 
1803 bp  48.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4113    96.43 
 
 
261 bp  48.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.896647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>