More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8303 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 478 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 472 aa  324  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  37.16 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  37.16 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 467 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 465 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 454 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  35.23 
 
 		 475 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 433 aa  256  6e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 437 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 464 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  37.72 
 
 		 443 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  33.19 
 
 		 490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 461 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  32.25 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 438 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 430 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 454 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 471 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  31 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 461 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 506 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 443 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  31.46 
 
 		 440 aa  154  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  31.99 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 426 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 440 aa  146  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 530 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 578 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.82 
 
 		 424 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 452 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 484 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 533 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  27.84 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  29.25 
 
 		 427 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  27.5 
 
 		 453 aa  116  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  45 
 
 		 198 aa  116  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 450 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 460 aa  116  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 432 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  27.76 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  27.25 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>