More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8299 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8299  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 325 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2543  Lytic transglycosylase catalytic  72 
 
 		 249 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0514  Lytic transglycosylase catalytic  68.22 
 
 		 254 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1465  lytic transglycosylase catalytic  66.13 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1014  Lytic transglycosylase catalytic  59.74 
 
 		 250 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2229  lytic transglycosylase, catalytic  56.34 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2555  Lytic transglycosylase catalytic  65.55 
 
 		 260 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00526771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3883  lytic transglycosylase catalytic  64.57 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2909  lytic transglycosylase, catalytic  53.33 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417434  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2995  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 287 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.891675  normal  0.0342596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2904  soluble lytic transglycosylase  46.72 
 
 		 197 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2866  Lytic transglycosylase catalytic  45 
 
 		 206 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918978  normal  0.297415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2103  lytic transglycosylase catalytic  45.08 
 
 		 179 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1733  lytic transglycosylase catalytic  43.7 
 
 		 219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.254136  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2017  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2606  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 		 175 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1443  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.37 
 
 		 214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1399  transglycosylase SLT domain-containing protein  42.37 
 
 		 214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.861628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3772  lytic transglycosylase catalytic  43.88 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3561  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0650  transglycosylase  39.05 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2303  lytic transglycosylase, catalytic  39.05 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.176095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6221  hypothetical protein  37.84 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.2 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2463  lytic transglycosylase, catalytic  42.39 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3663  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  40.2 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0582  lytic transglycosylase, catalytic  39 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  30.43 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  41.41 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2814  Lytic transglycosylase catalytic  41.86 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3773  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  29.57 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3465  lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0421  lytic transglycosylase, catalytic  32.79 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.829572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2397  lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279322  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  34.11 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2746  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2912  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.647608  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0896  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1017  lytic transglycosylase, catalytic  37.17 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2890  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.576703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  42.7 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  37 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  39.77 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  40.38 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2108  lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.344374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0908  soluble lytic murein transglycosylase-like  36.89 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207022  decreased coverage  0.000000101863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2520  lytic transglycosylase, catalytic  38.05 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  38 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  38 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  31.73 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  37.11 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  33.9 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0495  lytic transglycosylase, catalytic  39.81 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.358787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  36.09 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  36.27 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0066  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.38 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0067  transglycosylase SLT domain-containing protein  30.38 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  36 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 603 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  30.37 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  35.05 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1275  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 185 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 782 aa  56.6  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  35.11 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  33.07 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1226  Lytic transglycosylase catalytic  34.95 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0575  lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.445014 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  38.54 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.35 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  36.17 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3693  Lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00345887  hitchhiker  0.000000358582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2815  putative signal peptide protein  36.46 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642085  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 		 175 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0451  lytic transglycosylase, catalytic  34.96 
 
 		 217 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102068  normal  0.101572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2404  Lytic transglycosylase catalytic  33.93 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0077  lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  34.65 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3509  lytic transglycosylase catalytic  38.04 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  31.16 
 
 		 645 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 715 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>