More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8287 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  54.16 
 
 		 709 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  53.74 
 
 		 706 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  53.19 
 
 		 714 aa  648    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  54.72 
 
 		 712 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 709 aa  1418    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  53.09 
 
 		 687 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  51.31 
 
 		 703 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  50.68 
 
 		 703 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  51.69 
 
 		 714 aa  645    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  55.04 
 
 		 759 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  53.74 
 
 		 706 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  55.32 
 
 		 708 aa  663    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  50.79 
 
 		 711 aa  628  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  51.28 
 
 		 708 aa  628  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  51.63 
 
 		 687 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  54.15 
 
 		 734 aa  621  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  52.07 
 
 		 687 aa  622  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  49.72 
 
 		 717 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  49.31 
 
 		 714 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  49.86 
 
 		 713 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  48.1 
 
 		 717 aa  595  1e-169  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  50 
 
 		 694 aa  597  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  48.99 
 
 		 696 aa  595  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  50.46 
 
 		 706 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  48.58 
 
 		 685 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  50.75 
 
 		 703 aa  588  1e-166  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  47.39 
 
 		 713 aa  568  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  45.44 
 
 		 716 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  47.25 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  43.99 
 
 		 723 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  46.19 
 
 		 582 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  47.23 
 
 		 577 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  43.03 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  47.08 
 
 		 546 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  41.5 
 
 		 726 aa  439  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  45.65 
 
 		 577 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  39.16 
 
 		 715 aa  423  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  48.39 
 
 		 536 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  43.39 
 
 		 528 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  37.33 
 
 		 636 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  36.25 
 
 		 615 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.73 
 
 		 658 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.62 
 
 		 682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  36.39 
 
 		 684 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  35.84 
 
 		 683 aa  296  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.89 
 
 		 690 aa  296  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  35.45 
 
 		 683 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.32 
 
 		 688 aa  291  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.32 
 
 		 688 aa  291  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  36.27 
 
 		 679 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  36.29 
 
 		 684 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  36.02 
 
 		 681 aa  290  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.72 
 
 		 654 aa  289  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  36.26 
 
 		 679 aa  277  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.36 
 
 		 687 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.54 
 
 		 680 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  35.34 
 
 		 687 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  36.24 
 
 		 689 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 645 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  36.02 
 
 		 677 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  34.86 
 
 		 709 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.65 
 
 		 765 aa  250  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.39 
 
 		 667 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  35.01 
 
 		 692 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  29.71 
 
 		 751 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  33.81 
 
 		 740 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  49.01 
 
 		 369 aa  230  6e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  32.18 
 
 		 623 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.5 
 
 		 727 aa  227  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.86 
 
 		 754 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  30.48 
 
 		 690 aa  224  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  66.67 
 
 		 156 aa  206  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  30.15 
 
 		 669 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.15 
 
 		 662 aa  203  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  29.27 
 
 		 624 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  30.49 
 
 		 662 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  29.55 
 
 		 624 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  29.6 
 
 		 624 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  28.44 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  28.44 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  28.44 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  29.84 
 
 		 729 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  29.12 
 
 		 624 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  28.25 
 
 		 654 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  66.44 
 
 		 172 aa  171  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.51 
 
 		 654 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.27 
 
 		 670 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.95 
 
 		 652 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  28.4 
 
 		 652 aa  162  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  66.39 
 
 		 133 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  48.86 
 
 		 597 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  42.61 
 
 		 380 aa  157  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  65.81 
 
 		 129 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  64.91 
 
 		 129 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  32.91 
 
 		 660 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.53 
 
 		 595 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  54.55 
 
 		 133 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  33.16 
 
 		 603 aa  125  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1642  ParB-like nuclease  30.85 
 
 		 623 aa  125  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  34.45 
 
 		 606 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>