53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8282 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8282  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.167728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6059  hypothetical protein  77.74 
 
 		 313 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5569  hypothetical protein  70.79 
 
 		 309 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.0668153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7415  hypothetical protein  63.04 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.535459  normal  0.763852 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2130  hypothetical protein  63.3 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.632513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7719  hypothetical protein  62.96 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.746604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2786  hypothetical protein  60.61 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2860  hypothetical protein  62.91 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3176  hypothetical protein  63.14 
 
 		 311 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0169526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3336  hypothetical protein  65.17 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3563  hypothetical protein  60 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3917  hypothetical protein  60.4 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0769  hypothetical protein  60.26 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6193  hypothetical protein  57.88 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0113828  normal  0.0194796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4581  hypothetical protein  62.54 
 
 		 307 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.807477  normal  0.179791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4023  hypothetical protein  64.21 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850174 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4157  hypothetical protein  57.89 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0316718  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4225  hypothetical protein  57.57 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.263637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0573  hypothetical protein  61.2 
 
 		 306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.153804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1044  hypothetical protein  59.6 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.526643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0718  hypothetical protein  59.39 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1531  hypothetical protein  58.09 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0410908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2344  hypothetical protein  58.97 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3067  hypothetical protein  60.97 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3024  hypothetical protein  60.73 
 
 		 308 aa  355  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3519  hypothetical protein  57.76 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.980926  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1216  hypothetical protein  57.76 
 
 		 308 aa  355  6.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0190  hypothetical protein  58.11 
 
 		 302 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0261596  normal  0.413386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0375  hypothetical protein  58.17 
 
 		 309 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0533  hypothetical protein  54.88 
 
 		 307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.39822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3830  hypothetical protein  55.22 
 
 		 310 aa  328  6e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.279081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2516  hypothetical protein  53.82 
 
 		 313 aa  318  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2650  hypothetical protein  52.78 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.817192  normal  0.104991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1482  hypothetical protein  72.18 
 
 		 139 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3977  hypothetical protein  39.69 
 
 		 347 aa  185  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.439222  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5229  hypothetical protein  39.69 
 
 		 324 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.293502 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5166  hypothetical protein  41.22 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2193  hypothetical protein  37.28 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0425  hypothetical protein  37.27 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.428529  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4964  hypothetical protein  35.56 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3660  hypothetical protein  33.81 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0855564  decreased coverage  0.00000145048 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3994  hypothetical protein  33.81 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5341  hypothetical protein  31.9 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.725419 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5172  hypothetical protein  33.45 
 
 		 310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2986  hypothetical protein  33.64 
 
 		 117 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.57206  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5081  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3917  hypothetical protein  35.59 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000604853  unclonable  6.86407e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2151  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2646  hypothetical protein  34.82 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5711  hypothetical protein  34.95 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4151  hypothetical protein  31.82 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0043925  normal  0.91822 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1561  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>