More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8279 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8279  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 509 aa  1021    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325429  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  50.44 
 
 		 1424 aa  99  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.44 
 
 		 2954 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.27 
 
 		 1279 aa  93.6  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.99 
 
 		 2667 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.66 
 
 		 1499 aa  90.9  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.8 
 
 		 1156 aa  90.1  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.18 
 
 		 1236 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  40.82 
 
 		 572 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.65 
 
 		 3427 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.72 
 
 		 946 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  30.16 
 
 		 717 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.99 
 
 		 4798 aa  87  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.83 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.92 
 
 		 980 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  47.9 
 
 		 526 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.54 
 
 		 2346 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  46.15 
 
 		 460 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.05 
 
 		 2885 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.55 
 
 		 2775 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.09 
 
 		 2911 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  35.1 
 
 		 232 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  40.88 
 
 		 5171 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  45.9 
 
 		 1164 aa  81.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  30.48 
 
 		 4334 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  29.92 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  34.12 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  36.09 
 
 		 2329 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  49.51 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.42 
 
 		 1016 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.17 
 
 		 3619 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  41.61 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  43.94 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  42.28 
 
 		 1526 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  26.34 
 
 		 736 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  29.96 
 
 		 3619 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  47.17 
 
 		 2105 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  42.02 
 
 		 742 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  37.91 
 
 		 680 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.6 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  46.67 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.64 
 
 		 219 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.59 
 
 		 813 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.17 
 
 		 1795 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  43.51 
 
 		 4687 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.12 
 
 		 588 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.82 
 
 		 833 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  48 
 
 		 1814 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  37.9 
 
 		 724 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.69 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  42.98 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  39.04 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.98 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.26 
 
 		 709 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 795 aa  77  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.27 
 
 		 2678 aa  77  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  30.97 
 
 		 1712 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  40.48 
 
 		 3954 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  45.19 
 
 		 615 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  33.17 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  40.41 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.3 
 
 		 1532 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.04 
 
 		 1963 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  43.4 
 
 		 1175 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  40.35 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  48.04 
 
 		 833 aa  74.7  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 		 744 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  43.48 
 
 		 1383 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  40 
 
 		 2145 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.34 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  52.78 
 
 		 4106 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  27.81 
 
 		 3608 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  47.87 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 		 1017 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  39.55 
 
 		 1534 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 		 1022 aa  73.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39.68 
 
 		 639 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  41.51 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  45.65 
 
 		 1594 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  38.28 
 
 		 1287 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.57 
 
 		 2668 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  31.31 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 327 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  41.35 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  33.76 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2864  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  35.48 
 
 		 728 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.6 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  40.13 
 
 		 938 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.17 
 
 		 1363 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  44.34 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.48 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.67 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  37.01 
 
 		 769 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  36.51 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  33.15 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  47.56 
 
 		 1699 aa  71.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  39.34 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>