More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8245 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  80.74 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  79.18 
 
 		 271 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  73.03 
 
 		 271 aa  329  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  66.42 
 
 		 270 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  72.08 
 
 		 271 aa  319  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  51.15 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  51.97 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  52.71 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  52.17 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  52.76 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  51.16 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  52.76 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  50.2 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  44.75 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  46.64 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  52.08 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  46.56 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4222  ABC transporter related  47.28 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  51.95 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  50.42 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  49.58 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  48.52 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  43.03 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  46.22 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.67 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  45.28 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3736  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.652525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.18 
 
 		 405 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 490 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  42.75 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  39.69 
 
 		 274 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 536 aa  181  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  35.51 
 
 		 255 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17610  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  47.24 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  40.25 
 
 		 264 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  42.28 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  42.86 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1033  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.97 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  43.21 
 
 		 266 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  44.62 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  39.5 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  39.75 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  39.83 
 
 		 409 aa  175  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  48.43 
 
 		 243 aa  175  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1051  ABC transporter related  41.49 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  45.58 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2099  ABC transporter related  39.29 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  40.66 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3207  ABC transporter related  37.7 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.712241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3884  ABC transporter related  41.57 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  36.48 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  44.73 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001072  ferrichrome ABC transporter (ATP binding subunit) PvuE  37.45 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  41.53 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  47.41 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1426  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  36.48 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1929  ABC Fe+3 siderophore/cobalamin transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051174  normal  0.251825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  34.39 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  43.72 
 
 		 419 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  39.34 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  36.4 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  40.65 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.04 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  35.74 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5100  ABC transporter related  38.67 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130853  normal  0.02881 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  40.68 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  34.83 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  46.84 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  42.19 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>