87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8175 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  100 
 
 		 135 aa  262  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  87.3 
 
 		 131 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  72.73 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  71.21 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  73.17 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  63.08 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  60 
 
 		 133 aa  148  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2820  hypothetical protein  60 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.161166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  63.93 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3841  DoxX family protein  60.68 
 
 		 136 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  55.91 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  55.04 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  59.52 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  56.67 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3702  DoxX family protein  56.56 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.955639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  55.65 
 
 		 137 aa  126  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  57.03 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  56.8 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3404  DoxX family protein  56.52 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.246337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0868  DoxX  51.64 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2451  hypothetical protein  57.85 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1455  DoxX  50.77 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6801  hypothetical protein  51.2 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1514  DoxX  53.66 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4607  DoxX family protein  50.77 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3593  DoxX family protein  47.48 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  44.26 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1342  DoxX family protein  44.96 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3338  DoxX family protein  45.45 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  41.18 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  49.21 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0230  DoxX  40.15 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  unclonable  3.19876e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13081  integral membrane protein  45.04 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3384  DoxX family protein  43.61 
 
 		 180 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0241193  normal  0.0518004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  40.3 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3333  DoxX family protein  43.61 
 
 		 180 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671485  normal  0.176308 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0839  DoxX family protein  43.44 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3322  DoxX  43.61 
 
 		 180 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  39.2 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  43.36 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  37.3 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4945  DoxX family protein  39.68 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0094  DoxX family protein  40 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  40.34 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7016  DoxX family protein  38.21 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  40.15 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  35.77 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  36 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.85 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  37.4 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  35.77 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  35.54 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.68 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  31.21 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  36.07 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3881  DoxX family protein  32.54 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000792478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.81 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  30.77 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  31.85 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.07 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6404  DoxX  30.88 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256266  normal  0.0305648 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  34.11 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.71 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  33.33 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  33.57 
 
 		 198 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  33.07 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  34.33 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  32.77 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  32.56 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  30.89 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34190  predicted membrane protein  36.43 
 
 		 167 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  28.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  31.82 
 
 		 180 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  27.73 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  33.07 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  31.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  31.39 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  31.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4107  DoxX family protein  31.2 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  31.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  29.92 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1389  hypothetical protein  32.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0236091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  27.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  32.58 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0566  hypothetical protein  24.66 
 
 		 145 aa  40  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00681752  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0526  DoxX family protein  30.5 
 
 		 154 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0477659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>