More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7981 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  54.94 
 
 
1047 aa  1150    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  54.94 
 
 
1047 aa  1151    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  56.42 
 
 
1063 aa  1157    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  51.01 
 
 
1045 aa  1039    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.3 
 
 
1077 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.3 
 
 
1077 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  68.22 
 
 
1059 aa  1470    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  57.46 
 
 
1052 aa  1154    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  51.49 
 
 
1046 aa  1006    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  55.76 
 
 
1040 aa  1139    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  68.32 
 
 
1066 aa  1437    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.34 
 
 
1046 aa  651    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  57.93 
 
 
1047 aa  1162    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  37.04 
 
 
1064 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  56.88 
 
 
1039 aa  1124    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  51.71 
 
 
1049 aa  1105    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  55.39 
 
 
1052 aa  1154    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  51.33 
 
 
1047 aa  1117    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  51.43 
 
 
1045 aa  1089    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  50.76 
 
 
1045 aa  1072    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.2 
 
 
1077 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  53.03 
 
 
1047 aa  1096    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.62 
 
 
1049 aa  670    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.91 
 
 
1052 aa  667    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.49 
 
 
1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  51.48 
 
 
1045 aa  1097    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  51.48 
 
 
1045 aa  1084    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  57.25 
 
 
1056 aa  1165    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  68.46 
 
 
1051 aa  1447    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  68.39 
 
 
1044 aa  1436    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  50.86 
 
 
1100 aa  999    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  45.3 
 
 
1049 aa  934    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  51.94 
 
 
1091 aa  1050    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  68.75 
 
 
1043 aa  1469    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  54.27 
 
 
1048 aa  1137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36.37 
 
 
1059 aa  638    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  56.26 
 
 
1060 aa  1151    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  52.74 
 
 
1048 aa  1094    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  82.95 
 
 
1058 aa  1723    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  56.33 
 
 
1070 aa  1122    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.49 
 
 
1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  50.86 
 
 
1049 aa  1092    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  82.43 
 
 
1058 aa  1724    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  54.76 
 
 
1061 aa  1107    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  56.41 
 
 
1067 aa  1166    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  53.81 
 
 
1074 aa  1092    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  56.63 
 
 
1056 aa  1170    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 
1050 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  57 
 
 
1074 aa  1236    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.8 
 
 
1070 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  49.9 
 
 
1045 aa  1046    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  56.23 
 
 
1055 aa  1149    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  57.31 
 
 
1068 aa  1154    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  56.14 
 
 
1049 aa  1134    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  53.62 
 
 
1054 aa  1092    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  34.88 
 
 
1064 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  44.31 
 
 
1015 aa  908    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  63.38 
 
 
1059 aa  1358    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  56.58 
 
 
1039 aa  1165    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 
1077 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  49.77 
 
 
1094 aa  1033    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  75.38 
 
 
1051 aa  1573    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  67.98 
 
 
1043 aa  1465    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  56.52 
 
 
1039 aa  1170    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.19 
 
 
1042 aa  1154    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  54.64 
 
 
1042 aa  1118    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  75.34 
 
 
1052 aa  1599    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.3 
 
 
1077 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  37.23 
 
 
1040 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  56.03 
 
 
1070 aa  1124    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  56.13 
 
 
1056 aa  1136    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.02 
 
 
1083 aa  648    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  54.09 
 
 
1045 aa  1103    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  53.06 
 
 
1042 aa  1128    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  51.1 
 
 
1045 aa  1041    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  74.5 
 
 
1043 aa  1580    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  54.27 
 
 
1048 aa  1136    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.11 
 
 
1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  57.01 
 
 
1068 aa  1139    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  74.64 
 
 
1060 aa  1595    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  81.7 
 
 
1065 aa  1722    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  53.89 
 
 
1038 aa  1121    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.49 
 
 
1077 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  74.95 
 
 
1060 aa  1582    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  51.43 
 
 
1045 aa  1094    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.18 
 
 
1063 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  56.32 
 
 
1056 aa  1151    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  51.81 
 
 
1047 aa  1107    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  51.71 
 
 
1049 aa  1105    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  57.36 
 
 
1055 aa  1176    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  54.9 
 
 
1044 aa  1097    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  55.65 
 
 
1044 aa  1121    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  55.46 
 
 
1047 aa  1132    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 
1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  57.01 
 
 
1068 aa  1139    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>