More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7953 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7953  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 227 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.315447  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4343  isochorismatase hydrolase  42.11 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1059  isochorismatase hydrolase  40.71 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0989042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  41.12 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1098  isochorismatase hydrolase  34.22 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2747  N-carbamoylsarcosine amidase  36.36 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1694  isochorismatase hydrolase  41.33 
 
 		 209 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2511  isochorismatase hydrolase  37.67 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  35.94 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3491  N-carbamoylsarcosine amidase  36.95 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7125  hydrolase  37.5 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4294  isochorismatase hydrolase  38.68 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3931  isochorismatase hydrolase  39.45 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3487  isochorismatase hydrolase  37.22 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4328  isochorismatase hydrolase  36.77 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0839951  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  36.77 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  38.57 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  38.57 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4551  isochorismatase hydrolase  36.49 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28453  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  36.76 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1849  isochorismatase hydrolase  37.26 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2308  N-carbamoylsarcosine amidase  37.62 
 
 		 211 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.48308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3600  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.572531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  36.74 
 
 		 208 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2858  isochorismatase hydrolase  37.38 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4359  isochorismatase hydrolase  31.7 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222954  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  40.38 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2143  isochorismatase hydrolase  36.89 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  36.6 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4354  N-carbamoylsarcosine amidase  32.35 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1129  putative isochorismatase hydrolase  39.16 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3971  isochorismatase hydrolase  39.8 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4677  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0532887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0856  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  26.29 
 
 		 190 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  31.39 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2976  isochorismatase hydrolase  27.81 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  28.71 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2530  isochorismatase hydrolase  24.75 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  33.54 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4549  isochorismatase hydrolase  34.13 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.388724 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  32.72 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  30.5 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  30.1 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.49 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3430  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 201 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1431  isochorismatase hydrolase  22.64 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  28.98 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  30.86 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  24.02 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  24.61 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  27.92 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  24.02 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  27.33 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3108  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3260  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02097  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  32.37 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1870  isochorismatase  38.83 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.408465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2274  Isochorismatase  32.05 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.412367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  28.5 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  29.65 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  23.53 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  23.04 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  23.04 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  28.12 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_8142  predicted protein  38.54 
 
 		 96 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  29 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  25.77 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  31.75 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4750  isochorismatase hydrolase  27.54 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  26.15 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0706  putative isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>