17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7863 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7863  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 439 aa  866    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1530  tetratricopeptide TPR_4  85.65 
 
 		 439 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0930  hypothetical protein  51.62 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.995354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0739  hypothetical protein  37.88 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4618  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.49 
 
 		 883 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4908  hypothetical protein  29.71 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1873  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 470 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.853019 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0662  hypothetical protein  23.58 
 
 		 435 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1736  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 465 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0679  hypothetical protein  23.36 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3202  hypothetical protein  27.43 
 
 		 485 aa  84  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3622  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1532  hypothetical protein  25.13 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.340629 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07008  hypothetical protein  23.78 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2870  hypothetical protein  23.35 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00286473  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4360  hypothetical protein  26.56 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5015  hypothetical protein  24.55 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000194668  normal  0.287563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>