113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7862 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  86.52 
 
 		 419 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  76.72 
 
 		 409 aa  568  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  80.37 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  62.77 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 406 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  62.02 
 
 		 399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  62.2 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  61.52 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  63.1 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  62.74 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  50.4 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 401 aa  332  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  48.52 
 
 		 398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  52.38 
 
 		 425 aa  315  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  52.1 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 408 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  45.5 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 408 aa  276  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  42.42 
 
 		 408 aa  272  8.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  42.38 
 
 		 408 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  43.52 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 409 aa  265  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  45.21 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  41.9 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  43.4 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.94 
 
 		 420 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 392 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  43.55 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  35.92 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 393 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  40.27 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  35.19 
 
 		 422 aa  220  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  38.05 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  34.25 
 
 		 375 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 412 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 394 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  31.58 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 403 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  31.65 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  35.85 
 
 		 389 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  35.57 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  31.61 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  28.21 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  32.44 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  27.45 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.25 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  27.7 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  28.76 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  28.81 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  28.43 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  29.87 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  32.24 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.58 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  31.4 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  32.43 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 374 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.39 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>