More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7855 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7855  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 396 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1686  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  48.48 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01739  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  48.45 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1173  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  48.2 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0426063  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2409  mandelate racemase  44.53 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0679047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2499  mandelate racemase  44.53 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4167  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  42.31 
 
 		 396 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.585922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2458  mandelate racemase  44.78 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0484555  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4045  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  42.05 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2617  mandelate racemase  44.78 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588885  normal  0.211139 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2513  mandelate racemase  44.53 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.440237  normal  0.0724209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4225  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  41.54 
 
 		 396 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  41.79 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.128808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2380  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  44.62 
 
 		 400 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.162609  normal  0.98097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0954  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  36.73 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000745155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  39.78 
 
 		 386 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8006  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  38.02 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.8 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0100  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.96 
 
 		 382 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.85667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0127  galactonate dehydratase  31.93 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.425277  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0742  galactonate dehydratase  33.33 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.91 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4412  galactonate dehydratase  35.08 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.737612  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.56 
 
 		 415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1786  galactonate dehydratase  33.59 
 
 		 381 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.805255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  31.73 
 
 		 382 aa  179  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  31.98 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  31.98 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  31.89 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.48 
 
 		 372 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.15 
 
 		 384 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  31.22 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  32.33 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  32.13 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  31.73 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  31.73 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  31.73 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  31.73 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  31.22 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.63 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  31.88 
 
 		 382 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3624  galactonate dehydratase  32.88 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  31.88 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 		 381 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  31.25 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.18 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  31.36 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  31.36 
 
 		 401 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  31.96 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4035  galactonate dehydratase  33.42 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.66 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  32.14 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  30.99 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  30.41 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1380  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.08 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0045  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.33 
 
 		 381 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  31.18 
 
 		 384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  31.09 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5013  galactonate dehydratase  32.82 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4537  galactonate dehydratase  33.06 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  31.38 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.42 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.39 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4678  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.87 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3949  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.02 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6937  galactonate dehydratase  31.75 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00161206  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0074  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.29 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2244  galactonate dehydratase  32.97 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174504  hitchhiker  0.00000380774 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10599  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05520)  31.44 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.84 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  29.41 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0552  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.82 
 
 		 390 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02060  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  34.18 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2285  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.55 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.18 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  29.9 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0994  putative mandelate racemase / muconatelactonizing enzyme  32.35 
 
 		 392 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0973014  normal  0.486209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1901  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.52 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1303  gluconate dehydratase / galactonate dehydratase  28.89 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3673  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.97 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.232525  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0475  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.38 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0547  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.32 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  29.79 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  29.65 
 
 		 382 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3008  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.09 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.334254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  29.65 
 
 		 382 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2837  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.97 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679243  normal  0.849067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  31.34 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.12 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>