More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7815 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  868    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  64.35 
 
 
441 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  45.18 
 
 
468 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  44.84 
 
 
433 aa  360  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  44.39 
 
 
439 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  48.1 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  43.71 
 
 
439 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.82 
 
 
435 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  43.71 
 
 
439 aa  353  5e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.82 
 
 
435 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.82 
 
 
435 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  49.08 
 
 
452 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  47.98 
 
 
441 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.52 
 
 
439 aa  342  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  42.02 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.89 
 
 
437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  45.69 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.55 
 
 
441 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  43.09 
 
 
442 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  43.22 
 
 
430 aa  331  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  43.42 
 
 
439 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  46.6 
 
 
434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.36 
 
 
437 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  48.14 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  44.67 
 
 
441 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  41.59 
 
 
457 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  41.59 
 
 
457 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  43.4 
 
 
439 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  41.59 
 
 
457 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
435 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  43.55 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  44.69 
 
 
439 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
433 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 
432 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  44.79 
 
 
445 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  44.14 
 
 
442 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  44.22 
 
 
439 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0699  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  44.39 
 
 
436 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351028  hitchhiker  0.00674532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  44.22 
 
 
439 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  44.22 
 
 
439 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  44.22 
 
 
439 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4378  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.940021  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.44 
 
 
446 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
446 aa  320  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  45.43 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  45.43 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  45.43 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  44.21 
 
 
442 aa  320  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  42.2 
 
 
437 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  41.98 
 
 
463 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  42.02 
 
 
447 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  43.42 
 
 
482 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.74 
 
 
439 aa  316  7e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  44.08 
 
 
457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17780  major facilitator transporter  44.04 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 
437 aa  312  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  42.69 
 
 
455 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.65 
 
 
447 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1545  MFS family transporter  43.7 
 
 
470 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  43.24 
 
 
460 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  38.82 
 
 
461 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  38.82 
 
 
461 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  38.82 
 
 
461 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  44.72 
 
 
442 aa  309  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  43.16 
 
 
456 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0771  major facilitator transporter  43.4 
 
 
436 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
431 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1252  major facilitator transporter  43.4 
 
 
436 aa  309  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603112  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1224  major facilitator transporter  43.4 
 
 
436 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  43.82 
 
 
433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1540  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0867894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  45.06 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  41.45 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  40.52 
 
 
430 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  43.8 
 
 
439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  40.57 
 
 
455 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5243  major facilitator transporter  43.82 
 
 
439 aa  306  6e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4875  major facilitator transporter  43.82 
 
 
439 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 
420 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4964  major facilitator superfamily transporter  43.82 
 
 
439 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.99 
 
 
442 aa  305  9.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  42.64 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  42.56 
 
 
450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  42.11 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  42.11 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  38.41 
 
 
447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 
420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  42.11 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  43.07 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  43.98 
 
 
444 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  43.78 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.31 
 
 
441 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>