More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7811 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7811  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  698    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1685  regulatory protein, LacI  63.77 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0347621  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6027  transcriptional regulator, LacI family  54.97 
 
 		 342 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254846  normal  0.41211 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7182  transcriptional regulator, LacI family  52.05 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0798243  normal  0.0583699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5008  regulatory protein LacI  52.2 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0284302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3305  LacI family transcription regulator  42 
 
 		 350 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5026  transcriptional regulator, LacI family  38.73 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4043  transcriptional regulator, LacI family  38.66 
 
 		 373 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2766  LacI family transcription regulator  40.32 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4170  LacI family transcription regulator  37.64 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50220  LacI regulatory protein  38.19 
 
 		 379 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3017  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0238556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2053  LacI family transcription regulator  30.72 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0437  LacI family transcription regulator  32.89 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7226  transcriptional regulator, LacI family  32.89 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3990  LacI family transcription regulator  34 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1949  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 351 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0551  LacI family transcription regulator  31.3 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5753  regulatory protein LacI  33.43 
 
 		 335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0380737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0549  LacI family transcription regulator  30.64 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0036  LacI family transcription regulator  29.81 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3911  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1455  regulatory protein, LacI  32.24 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3413  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.603952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6779  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.156917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3711  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2712  LacI family transcription regulator  30.1 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2039  regulatory protein LacI  30.1 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal  0.671678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3413  regulatory protein LacI  28.03 
 
 		 343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2792  regulatory protein LacI  33.11 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1050  transcriptional regulator, LacI family  29.07 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.190777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6372  LacI family transcription regulator  27.99 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.787329  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0917  regulatory protein LacI  28.95 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5639  transcriptional regulator, LacI family  29.22 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26190  LacI regulatory protein  26.56 
 
 		 340 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0698  LacI family transcription regulator  28.38 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2296  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.413122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3354  transcriptional regulator, LacI family  28.21 
 
 		 343 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3591  regulatory protein LacI  27.99 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2492  LacI family transcription regulator  28.3 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.804528  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2736  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.871299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3834  transcriptional regulator LacI family  29.93 
 
 		 346 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0515953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6011  LacI family transcription regulator  28.52 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3966  regulatory protein, LacI  26.82 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1060  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.234055  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3771  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  0.844233 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2072  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.538239  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2683  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 354 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2712  LacI family transcription regulator  28.14 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2322  regulatory protein, LacI  28.52 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19190  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.329704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2615  regulatory protein, LacI  24.78 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.546445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0908  LacI family transcription regulator  27.17 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0876501  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0614  LacI family transcription regulator  26.81 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2405  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3483  transcriptional regulator, LacI family  27.67 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.617656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0444  LacI family transcription regulator  24.8 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.104683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2767  transcriptional regulator, LacI family  26.59 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  28.73 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3532  LacI family transcription regulator  24.15 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.895947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  25.82 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3746  regulatory protein LacI  26.01 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4879  transcriptional regulator, LacI family  22.86 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.77144  normal  0.328602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  28.72 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  24.05 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1852  regulatory protein, LacI  26.22 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.206748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.97 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  26.32 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  24.31 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2967  LacI family transcription regulator  26.86 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  23.2 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3019  LacI family transcription regulator  26.86 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2882  LacI family transcription regulator  26.86 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4494  transcriptional regulator, LacI family  22.74 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3511  transcriptional regulator, LacI family  27.52 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0677107  normal  0.351268 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27300  Transcriptional regulator, LacI family  27.3 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0157  transcriptional regulator, LacI family  21.55 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3388  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0528  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6321  LacI family transcription regulator  26.29 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4284  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  23.89 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3062  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2031  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0336  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.543467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0349  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.912669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2253  LacI family transcription regulator  28.09 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3558  LacI family transcription regulator  28.18 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0425  transcriptional regulator, LacI family  31.17 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.401963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  56.14 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  23.79 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  42.17 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>