More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7807 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7807  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
336 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1678  inositol 2-dehydrogenase  74.03 
 
 
336 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187715  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  72.02 
 
 
336 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4015  inositol 2-dehydrogenase  70.45 
 
 
334 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3283  myo-inositol 2-dehydrogenase  69.85 
 
 
341 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4658  inositol 2-dehydrogenase  62.61 
 
 
337 aa  450  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50110  Myo-inositol 2-dehydrogenase  61.31 
 
 
338 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3268  myo-inositol 2-dehydrogenase  62.61 
 
 
336 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00502229  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3494  myo-inositol 2-dehydrogenase  61.9 
 
 
336 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0220757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1246  putative oxidoreductase myo-inositol 2-dehydrogenase signal peptide protein  60.42 
 
 
337 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.405196  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1887  inositol 2-dehydrogenase  58.33 
 
 
337 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.28659 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2417  Inositol 2-dehydrogenase  55.49 
 
 
337 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1406  inositol 2-dehydrogenase  58.04 
 
 
337 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2925  inositol 2-dehydrogenase  60 
 
 
337 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.943398  normal  0.313132 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4572  myo-inositol 2-dehydrogenase  58.04 
 
 
337 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707429  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0946  myo-inositol 2-dehydrogenase  58.33 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1308  inositol 2-dehydrogenase  58.04 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1428  inositol 2-dehydrogenase  58.33 
 
 
337 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1347  inositol 2-dehydrogenase  57.74 
 
 
337 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0653  oxidoreductase domain-containing protein  51.04 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4707  inositol 2-dehydrogenase  47.77 
 
 
336 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0994967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2766  oxidoreductase domain protein  51.48 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  51.79 
 
 
335 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1809  inositol 2-dehydrogenase  46.73 
 
 
341 aa  278  9e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.762246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0731  Inositol 2-dehydrogenase  42.38 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4051  Inositol 2-dehydrogenase  43.5 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814011  normal  0.183067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  39.88 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  39.29 
 
 
337 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2747  Inositol 2-dehydrogenase  40.71 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.505904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3609  Inositol 2-dehydrogenase  37.27 
 
 
367 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0387  inositol 2-dehydrogenase  35.36 
 
 
343 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4020  inositol 2-dehydrogenase  35.4 
 
 
342 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141873  normal  0.256136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2598  inositol 2-dehydrogenase  34.17 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652194  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1723  myo-inositol 2-dehydrogenase  36.14 
 
 
347 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1526  Inositol 2-dehydrogenase  28.93 
 
 
335 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 
342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  29.39 
 
 
340 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1661  oxidoreductase family protein  30.7 
 
 
345 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154262  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1838  homoserine dehydrogenase  30.7 
 
 
345 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1683  oxidoreductase family protein  30.7 
 
 
345 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  29.97 
 
 
334 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0732  oxidoreductase family protein  30.38 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0430  myo-inositol dehydrogenase  30.38 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104754  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4853  Inositol 2-dehydrogenase  30.93 
 
 
339 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156724  normal  0.0403162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2641  myo-inositol dehydrogenase  30.13 
 
 
345 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235114  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  26 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  32.27 
 
 
336 aa  110  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  30.46 
 
 
331 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  25.89 
 
 
366 aa  109  6e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.21 
 
 
349 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.48 
 
 
329 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  29.45 
 
 
340 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2715  inositol 2-dehydrogenase  30.48 
 
 
328 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3283  inositol 2-dehydrogenase  29.7 
 
 
331 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00244107 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2075  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.48 
 
 
328 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2686  inositol 2-dehydrogenase  30.48 
 
 
328 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
366 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  29.09 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.99 
 
 
329 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0918  myo-inositol dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
366 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1836  myo-inositol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6014  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.28 
 
 
353 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0731  myo-inositol dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1682  putative inositol 2-dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1449  myo-inositol dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0431  myo-inositol dehydrogenase  29.55 
 
 
339 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  30.03 
 
 
349 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1727  oxidoreductase-like protein  29.91 
 
 
331 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.039355  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1595  inositol 2-dehydrogenase  29.38 
 
 
339 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  29.3 
 
 
330 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1416  myo-inositol 2-dehydrogenase  26.49 
 
 
328 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0285646  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  30.32 
 
 
336 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31420  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.95 
 
 
335 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0833  inositol 2-dehydrogenase  30.07 
 
 
368 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000914593  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  27.08 
 
 
328 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1660  putative inositol 2-dehydrogenase  28.98 
 
 
339 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0611  inositol 2-dehydrogenase  30.31 
 
 
328 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  29.03 
 
 
330 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
334 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  29.65 
 
 
323 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  31.91 
 
 
325 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  32.43 
 
 
338 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2740  inositol 2-dehydrogenase  29.52 
 
 
328 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2759  oxidoreductase domain protein  30.1 
 
 
336 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  29.08 
 
 
342 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  30.84 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2804  Inositol 2-dehydrogenase  28.4 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1599  oxidoreductase domain-containing protein  26.25 
 
 
332 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4156  Inositol 2-dehydrogenase  30 
 
 
352 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.882438 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2642  myo-inositol dehydrogenase  29.39 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.48575  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  26.56 
 
 
342 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  28.57 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1523  Inositol 2-dehydrogenase  27.96 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  29.91 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3047  myo-inositol 2-dehydrogenase, putative  27.78 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0534823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  29.97 
 
 
336 aa  96.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>