142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7785 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7785  integrase catalytic region  100 
 
 		 44 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00395813  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 301 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  75 
 
 		 244 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  70.45 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  72.73 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  72.73 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  70.45 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  70.45 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0854  hypothetical protein  70.45 
 
 		 44 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  65.91 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  65.91 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  68.18 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  68.18 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  63.64 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  63.64 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02251  transposase  61.36 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1287  hypothetical protein  63.64 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.868264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  65.85 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  72.22 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  75 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  72.22 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  72.22 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  60.87 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  69.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  69.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  69.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  59.09 
 
 		 304 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  66.67 
 
 		 304 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  66.67 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  58.7 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  66.67 
 
 		 303 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  56.82 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 295 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  56.82 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  56.82 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  67.65 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  67.65 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  58.54 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  54.55 
 
 		 301 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  55.56 
 
 		 304 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  56.1 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  56.1 
 
 		 294 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  54.55 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  54.55 
 
 		 296 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>