19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7767 on replicon NC_011890
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  100 
 
 
846 aa  1721    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7757  hypothetical protein  67.82 
 
 
885 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  32.71 
 
 
751 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  34.09 
 
 
493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  27.87 
 
 
526 aa  162  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  34.26 
 
 
681 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  31.62 
 
 
825 aa  155  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  24.57 
 
 
724 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  25.26 
 
 
689 aa  98.2  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0668  hypothetical protein  25.28 
 
 
833 aa  79.3  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  30.3 
 
 
485 aa  70.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  29.3 
 
 
756 aa  65.1  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3313  hypothetical protein  25.57 
 
 
444 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1346  hypothetical protein  29 
 
 
793 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.590943  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  26.35 
 
 
566 aa  56.2  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5170  hypothetical protein  25.57 
 
 
401 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.196201  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2457  hypothetical protein  25.16 
 
 
820 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0325  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.606726  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  26.51 
 
 
920 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>